40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0578 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_0578  Colicin V production protein  100 
 
 		 184 aa  358  2e-98  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.637194  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1144  CvpA family protein  43.81 
 
 		 191 aa  163  1.0000000000000001e-39  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.111431  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0486  conserved hypothetical integral membrane protein, CvpA family  41.71 
 
 		 189 aa  147  7e-35  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0223  CvpA family protein  42.62 
 
 		 206 aa  145  3e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.903437  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0448  cvpA family protein  42.78 
 
 		 187 aa  136  2e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.179388  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0999  CvpA family protein  46.45 
 
 		 205 aa  136  2e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000386189  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1558  cvpA family protein  41.76 
 
 		 190 aa  135  2e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.383217  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0422  cvpA family protein  42.78 
 
 		 187 aa  136  2e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00865734  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1644  CvpA family protein  33.86 
 
 		 218 aa  123  1e-27  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1271  colicin V production protein  42.42 
 
 		 216 aa  107  7.000000000000001e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2162  colicin V production protein  25.64 
 
 		 193 aa  60.1  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.340208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2875  putative bacteriocin production related protein  30.25 
 
 		 164 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3964  colicin V production protein  33.96 
 
 		 164 aa  51.2  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4403  colicin V production protein  33.96 
 
 		 164 aa  51.2  0.000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.454399  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3564  colicin V production protein  33.96 
 
 		 164 aa  51.2  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4616  colicin V production protein  29.66 
 
 		 164 aa  51.2  0.000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.186008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2119  colicin V production protein  33.96 
 
 		 164 aa  50.8  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.73318  normal  0.0950051 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2461  colicin V production protein  28.77 
 
 		 165 aa  48.5  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.400499  normal  0.228634 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2300  colicin V production protein  27.59 
 
 		 171 aa  48.1  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.113958  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4380  colicin V production protein  26.88 
 
 		 164 aa  47.8  0.00009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.452488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1329  Colicin V production protein  30.07 
 
 		 192 aa  47.8  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0804105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6836  Colicin V production protein  29.01 
 
 		 164 aa  47  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.612916 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3859  colicin V production protein  31.13 
 
 		 164 aa  46.6  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3354  colicin V production protein  31.13 
 
 		 164 aa  46.6  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0663199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2073  2-oxoglutarate dehydrogenase, E1 component  23.81 
 
 		 168 aa  44.7  0.0009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.576692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3077  Colicin V production protein  24.31 
 
 		 158 aa  43.9  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.770622 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2147  colicin V production protein  27.7 
 
 		 162 aa  43.9  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.936952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0771  colicin V production protein  30.16 
 
 		 182 aa  43.1  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4093  colicin V production protein  23.31 
 
 		 189 aa  43.1  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.799722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0510  Colicin V production protein  26.24 
 
 		 190 aa  43.5  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.103168  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0780  colicin V production protein  22.99 
 
 		 173 aa  43.1  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3799  colicin V production protein  28 
 
 		 160 aa  43.5  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2454  colicin V production family protein  26.92 
 
 		 155 aa  42.7  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0393  colicin V production protein  26.67 
 
 		 178 aa  42.7  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1872  colicin V production protein  25.52 
 
 		 159 aa  42.7  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.356571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2024  hypothetical protein  29.11 
 
 		 184 aa  42.4  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1966  colicin V production protein  27.7 
 
 		 166 aa  42.4  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.530952 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0307  CvpA family protein  25.44 
 
 		 206 aa  42  0.004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.617948  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02100  hypothetical protein  30.28 
 
 		 178 aa  41.2  0.008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23900  hypothetical protein  28.38 
 
 		 180 aa  40.8  0.01  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00157781  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>