57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0236 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_0236  dihydroneopterin aldolase  100 
 
 
111 aa  227  5e-59  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0665  dihydroneopterin aldolase  40.37 
 
 
109 aa  84.3  5e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1694  dihydroneopterin aldolase  40.38 
 
 
108 aa  73.9  0.0000000000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000000764961  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0981  dihydroneopterin aldolase  34.62 
 
 
108 aa  68.9  0.00000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.0043916  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1503  dihydroneopterin aldolase  32.41 
 
 
104 aa  64.3  0.0000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1602  FolB domain-containing protein  34.86 
 
 
105 aa  58.5  0.00000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0241  FolB domain-containing protein  31.96 
 
 
105 aa  58.2  0.00000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0405  FolB domain-containing protein  34.86 
 
 
105 aa  57.8  0.00000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.791342  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0380  FolB domain-containing protein  34.86 
 
 
105 aa  57.8  0.00000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3410  bifunctional dihydroneopterin aldolase/dihydroneopterin triphosphate 2'-epimerase  31.13 
 
 
117 aa  51.6  0.000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0269444  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0176  dihydroneopterin aldolase  29.36 
 
 
105 aa  50.8  0.000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3569  bifunctional dihydroneopterin aldolase/dihydroneopterin triphosphate 2'-epimerase  30.19 
 
 
117 aa  50.1  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0611141  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1208  dihydroneopterin aldolase  30.7 
 
 
140 aa  48.9  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1182  dihydroneopterin aldolase  31.13 
 
 
140 aa  49.3  0.00002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.275073 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2011  hypothetical protein  22.77 
 
 
112 aa  45.4  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2692  dihydroneopterin aldolase  27.72 
 
 
117 aa  45.1  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00414447  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0329  dihydroneopterin aldolase  31.13 
 
 
117 aa  45.4  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.83425 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4295  bifunctional dihydroneopterin aldolase/dihydroneopterin triphosphate 2'-epimerase  28.3 
 
 
119 aa  45.4  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00183631  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0828  dihydroneopterin aldolase  27.36 
 
 
117 aa  44.7  0.0005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0250396  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2006  hypothetical protein  21.78 
 
 
112 aa  44.3  0.0005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0073  dihydroneopterin aldolase  25.88 
 
 
126 aa  44.3  0.0006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5147  dihydroneopterin aldolase  34.58 
 
 
146 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0451555  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3220  dihydroneopterin aldolase  34.58 
 
 
146 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0558  bifunctional dihydroneopterin aldolase/dihydroneopterin triphosphate 2'-epimerase  25.24 
 
 
119 aa  43.9  0.0008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000172177  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0298  bifunctional dihydroneopterin aldolase/dihydroneopterin triphosphate 2'-epimerase  25.24 
 
 
119 aa  43.9  0.0008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00167375  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0639  bifunctional dihydroneopterin aldolase/dihydroneopterin triphosphate 2'-epimerase  25.24 
 
 
119 aa  43.9  0.0008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00488961  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1298  dihydroneopterin aldolase  25 
 
 
122 aa  43.5  0.0009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0641  bifunctional dihydroneopterin aldolase/dihydroneopterin triphosphate 2'-epimerase  26.85 
 
 
122 aa  43.5  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000115743  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4370  bifunctional dihydroneopterin aldolase/dihydroneopterin triphosphate 2'-epimerase  26.85 
 
 
122 aa  43.5  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.516062  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3351  bifunctional dihydroneopterin aldolase/dihydroneopterin triphosphate 2'-epimerase  26.85 
 
 
122 aa  43.5  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.732659  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5132  dihydroneopterin aldolase  34.58 
 
 
146 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.659907  normal  0.775541 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3521  bifunctional dihydroneopterin aldolase/dihydroneopterin triphosphate 2'-epimerase  26.85 
 
 
122 aa  43.5  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.316969  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02878  hypothetical protein  26.85 
 
 
122 aa  43.5  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000977298  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1880  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  29.59 
 
 
276 aa  43.1  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00242746  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02928  bifunctional dihydroneopterin aldolase/dihydroneopterin triphosphate 2'-epimerase  26.85 
 
 
122 aa  43.5  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00113929  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0642  dihydroneopterin aldolase  26.85 
 
 
122 aa  43.5  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0062144  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4340  dihydroneopterin aldolase  31.13 
 
 
123 aa  43.1  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4826  dihydroneopterin aldolase  32.71 
 
 
148 aa  43.5  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.829975  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3236  bifunctional dihydroneopterin aldolase/dihydroneopterin triphosphate 2'-epimerase  26.85 
 
 
122 aa  43.5  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1044  dihydroneopterin aldolase  24.75 
 
 
119 aa  42.4  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00112146  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2234  dihydroneopterin aldolase  24.21 
 
 
121 aa  42.7  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0794  dihydroneopterin aldolase  28.3 
 
 
120 aa  42.4  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.19787  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3489  bifunctional dihydroneopterin aldolase/dihydroneopterin triphosphate 2'-epimerase  26.85 
 
 
122 aa  42  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3466  bifunctional dihydroneopterin aldolase/dihydroneopterin triphosphate 2'-epimerase  26.85 
 
 
119 aa  41.6  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.145042  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3460  bifunctional dihydroneopterin aldolase/dihydroneopterin triphosphate 2'-epimerase  26.85 
 
 
119 aa  41.6  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.632463  normal  0.125867 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3396  bifunctional dihydroneopterin aldolase/dihydroneopterin triphosphate 2'-epimerase  26.85 
 
 
119 aa  41.6  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.166332  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3392  bifunctional dihydroneopterin aldolase/dihydroneopterin triphosphate 2'-epimerase  26.85 
 
 
119 aa  41.6  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000166659  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3562  bifunctional dihydroneopterin aldolase/dihydroneopterin triphosphate 2'-epimerase  26.85 
 
 
119 aa  41.6  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0891124 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3783  D-erythro-7,8-dihydroneopterin triphosphate 2'-epimerase  35.21 
 
 
135 aa  41.6  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4542  dihydroneopterin aldolase  32.71 
 
 
148 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5065  dihydroneopterin aldolase  32.71 
 
 
146 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3508  dihydroneopterin aldolase  29.91 
 
 
146 aa  41.2  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2634  dihydroneopterin aldolase  24.74 
 
 
121 aa  41.2  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0808161  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03450  dihydroneopterin aldolase FolB, putative  30.69 
 
 
117 aa  41.2  0.005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1764  dihydroneopterin aldolase  24.21 
 
 
126 aa  40.8  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.276601 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3461  bifunctional dihydroneopterin aldolase/dihydroneopterin triphosphate 2'-epimerase  25.93 
 
 
122 aa  40.4  0.008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00080396  normal  0.166638 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1300  D-erythro-7,8-dihydroneopterin triphosphate 2'-epimerase  29.13 
 
 
129 aa  40.4  0.009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>