20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3659 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3659  hypothetical protein  100 
 
 		 346 aa  697    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.421403 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2178  acyltransferase domain, membrane protein  34.26 
 
 		 348 aa  169  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1158  acyltransferase 3  30 
 
 		 385 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00977171  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3331  hypothetical protein  29.89 
 
 		 349 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3653  acyltransferase 3  31.65 
 
 		 345 aa  115  7.999999999999999e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0291  acyltransferase 3  31.37 
 
 		 345 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3865  acyltransferase 3  31.74 
 
 		 345 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00949933 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4165  acyltransferase 3  30.9 
 
 		 345 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3970  acyltransferase 3  30.62 
 
 		 345 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4078  acyltransferase 3  30.62 
 
 		 345 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0320  hypothetical protein  30.68 
 
 		 335 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4047  acyltransferase 3  30.62 
 
 		 345 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3675  acyltransferase 3  29.86 
 
 		 345 aa  107  2e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1771  acyltransferase 3  27.57 
 
 		 345 aa  100  4e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2797  acyltransferase 3  26.39 
 
 		 363 aa  92.8  8e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0102  acyltransferase 3  28.04 
 
 		 368 aa  90.9  3e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0248047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1380  hypothetical protein  27.78 
 
 		 321 aa  76.6  0.0000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.786153 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1141  acyltransferase 3  25 
 
 		 361 aa  60.5  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.283735  normal  0.618576 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3838  acyltransferase 3  21.9 
 
 		 347 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0792  hypothetical protein  23.69 
 
 		 359 aa  43.5  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.298441  normal  0.0360506 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>