33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1839 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1839  periplasmic protein thiol:disulfide oxidoreductase DsbE  100 
 
 		 145 aa  305  1.0000000000000001e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0250  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  35.66 
 
 		 153 aa  73.9  0.0000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.401314 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0560  hypothetical protein  30.41 
 
 		 153 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.343341  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0242  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  34.27 
 
 		 153 aa  72.8  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00152828 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2847  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  31.25 
 
 		 152 aa  70.9  0.000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000365676  normal  0.0147483 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3892  hypothetical protein  27.89 
 
 		 162 aa  70.1  0.000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.942271 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2550  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  32.35 
 
 		 154 aa  69.7  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.367677  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0901  hypothetical protein  29.05 
 
 		 153 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2604  hypothetical protein  29.05 
 
 		 153 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2465  hypothetical protein  29.05 
 
 		 153 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.464565  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1866  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  32.86 
 
 		 157 aa  67.8  0.00000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1534  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  31.94 
 
 		 153 aa  67.4  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0482501 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0626  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  29.33 
 
 		 152 aa  67.4  0.00000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.922847 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0696  hypothetical protein  31.51 
 
 		 164 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.60473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1115  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  28.28 
 
 		 148 aa  61.2  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0906319 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3639  hypothetical protein  27.1 
 
 		 164 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.176214  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3868  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  31.43 
 
 		 159 aa  60.8  0.000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0853747  normal  0.686212 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4981  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  28.77 
 
 		 164 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.348147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3386  hypothetical protein  28.77 
 
 		 164 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.680695  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5306  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  28.77 
 
 		 164 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0449743 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1119  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  26.03 
 
 		 148 aa  53.9  0.0000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.47591 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6293  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  27.7 
 
 		 143 aa  53.1  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4479  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  29.5 
 
 		 146 aa  52.8  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0829  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  29.2 
 
 		 151 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.236883  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4924  hypothetical protein  28.77 
 
 		 164 aa  51.2  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.486697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4405  hypothetical protein  28.77 
 
 		 164 aa  51.2  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.105181 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29970  Polyketide cyclase / dehydrase and lipid transport  28.03 
 
 		 194 aa  50.1  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1474  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  25.18 
 
 		 157 aa  45.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0691  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  25.19 
 
 		 160 aa  43.9  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0247  hypothetical protein  28.97 
 
 		 150 aa  43.5  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0483  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  26.15 
 
 		 134 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.506287 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3783  hypothetical protein  23.68 
 
 		 153 aa  41.6  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.380581 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3920  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  25.78 
 
 		 136 aa  40.8  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.170348  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>