53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0751 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0751  hypothetical protein  100 
 
 		 763 aa  1575    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.567279 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2314  hypothetical protein  31.74 
 
 		 735 aa  334  4e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58690  hypothetical protein  30.22 
 
 		 751 aa  318  2e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.544037 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5140  hypothetical protein  31.1 
 
 		 749 aa  316  9.999999999999999e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0779  hypothetical protein  30.3 
 
 		 766 aa  314  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0816  hypothetical protein  29.72 
 
 		 751 aa  304  5.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.229432 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0949  hypothetical protein  28.65 
 
 		 751 aa  293  1e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0786  hypothetical protein  29.95 
 
 		 729 aa  291  3e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.341709 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0875  hypothetical protein  33.05 
 
 		 842 aa  290  8e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0738842 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0953  hypothetical protein  27.34 
 
 		 766 aa  259  1e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0596872  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2114  hypothetical protein  27.07 
 
 		 787 aa  254  6e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.190473  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0822  hypothetical protein  28.09 
 
 		 719 aa  234  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2241  hypothetical protein  25.93 
 
 		 782 aa  233  8.000000000000001e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0764  hypothetical protein  26.15 
 
 		 781 aa  226  1e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4406  hypothetical protein  28.32 
 
 		 721 aa  219  2e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.117254  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3053  hypothetical protein  27.62 
 
 		 732 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0811  hypothetical protein  32.43 
 
 		 717 aa  193  1e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.083655  normal  0.106889 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0788  hypothetical protein  33.83 
 
 		 745 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0820  cell division protein FtsZ  23.86 
 
 		 764 aa  178  4e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0125442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04577  hypothetical protein  24.97 
 
 		 763 aa  173  1e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0699  protein of unknown function DUF1631  23.17 
 
 		 773 aa  155  2.9999999999999998e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.268383  normal  0.290029 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1435  hypothetical protein  25.16 
 
 		 771 aa  152  2e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3555  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  25 
 
 		 1249 aa  137  5e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3274  protein of unknown function DUF1631  26.97 
 
 		 760 aa  108  3e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4085  hypothetical protein  27.51 
 
 		 784 aa  105  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0688006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4133  hypothetical protein  23.45 
 
 		 687 aa  105  3e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4642  hypothetical protein  27.39 
 
 		 795 aa  99  3e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0346  hypothetical protein  28.24 
 
 		 850 aa  97.4  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.198379 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0836  hypothetical protein  24.91 
 
 		 801 aa  93.2  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0279  hypothetical protein  27.48 
 
 		 773 aa  92.8  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0968275 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4003  hypothetical protein  27.11 
 
 		 784 aa  92  4e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.677429 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3353  hypothetical protein  27.11 
 
 		 784 aa  92  4e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.739095  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2129  hypothetical protein  20.85 
 
 		 744 aa  90.9  9e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.796066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0761  hypothetical protein  25.34 
 
 		 828 aa  90.1  1e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3864  hypothetical protein  23.51 
 
 		 790 aa  88.2  6e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4643  hypothetical protein  27 
 
 		 810 aa  87.4  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.43497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3883  hypothetical protein  26.95 
 
 		 780 aa  86.3  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.428838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2229  hypothetical protein  23.16 
 
 		 1201 aa  85.1  0.000000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.186545  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2088  hypothetical protein  28.95 
 
 		 524 aa  83.6  0.00000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.721008 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2170  hypothetical protein  24.57 
 
 		 737 aa  81.3  0.00000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0848  hypothetical protein  23.51 
 
 		 824 aa  81.3  0.00000000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5117  protein of unknown function DUF1631  24.35 
 
 		 804 aa  73.9  0.000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1247  hypothetical protein  25.21 
 
 		 782 aa  70.9  0.00000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2036  hypothetical protein  23.48 
 
 		 473 aa  68.9  0.0000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0847  hypothetical protein  25 
 
 		 890 aa  63.2  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.591232  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0851  hypothetical protein  26.35 
 
 		 445 aa  61.2  0.00000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.509842  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0429  hypothetical protein  20.86 
 
 		 727 aa  61.2  0.00000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.9239 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0969  hypothetical protein  26.35 
 
 		 445 aa  60.8  0.00000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.852631  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2151  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  21.99 
 
 		 1072 aa  60.5  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.439713  normal  0.242332 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1802  hypothetical protein  33.33 
 
 		 747 aa  45.1  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.196203 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4528  hypothetical protein  19.92 
 
 		 854 aa  44.3  0.008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.134152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2607  hypothetical protein  23.73 
 
 		 741 aa  44.3  0.009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.978979  normal  0.181183 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0773  hypothetical protein  23.05 
 
 		 724 aa  44.3  0.01  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.639305  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>