12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0207 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0207  cobyric acid synthase CobQ  100 
 
 		 406 aa  837    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3041  hypothetical protein  42.68 
 
 		 397 aa  282  8.000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.252663 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2741  hypothetical protein  42.68 
 
 		 397 aa  282  8.000000000000001e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.326468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2605  hypothetical protein  42.43 
 
 		 397 aa  281  1e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.908285 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0319  hypothetical protein  42.49 
 
 		 396 aa  276  4e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.452457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1261  hypothetical protein  42.05 
 
 		 389 aa  275  8e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.536599  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3184  cobyric acid synthase CobQ  37.57 
 
 		 380 aa  228  2e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.999187  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2871  hypothetical protein  41.55 
 
 		 292 aa  195  9e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0664  hypothetical protein  29.78 
 
 		 381 aa  126  6e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.105656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4360  hypothetical protein  25.13 
 
 		 384 aa  80.9  0.00000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2870  hypothetical protein  34.41 
 
 		 90 aa  47.4  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5056  beta-lactamase domain protein  35.16 
 
 		 399 aa  42.7  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>