15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_2840 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009052  Sbal_2840  hypothetical protein  100 
 
 
329 aa  689    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4937  hypothetical protein  51.47 
 
 
336 aa  338  9e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0259  hypothetical protein  51.42 
 
 
293 aa  308  9e-83  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1693  hypothetical protein  38.76 
 
 
315 aa  95.9  9e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.388652 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2402  hypothetical protein  46.3 
 
 
413 aa  92  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.183698  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0265  hypothetical protein  40.62 
 
 
154 aa  79.7  0.00000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3571  hypothetical protein  41.9 
 
 
318 aa  79  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.926328  normal  0.145277 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2162  hypothetical protein  29.41 
 
 
439 aa  66.2  0.0000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0873  hypothetical protein  31.76 
 
 
345 aa  58.5  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0164  hypothetical protein  29.63 
 
 
936 aa  50.4  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00430  hypothetical protein  25.64 
 
 
936 aa  49.7  0.00006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0433  hypothetical protein  26.17 
 
 
444 aa  48.1  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.374526 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5757  hypothetical protein  30.93 
 
 
436 aa  47  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3754  hypothetical protein  33.9 
 
 
320 aa  46.6  0.0006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3763  hypothetical protein  30.3 
 
 
444 aa  43.9  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.493237  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>