20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_2567 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_1854  hypothetical protein  79.77 
 
 
610 aa  990    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1777  hypothetical protein  92.14 
 
 
608 aa  1133    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00185901  hitchhiker  0.000156228 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2146  hypothetical protein  54.04 
 
 
637 aa  674    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00198239  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2682  hypothetical protein  92.14 
 
 
608 aa  1133    Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000455476  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1949  hypothetical protein  55.57 
 
 
618 aa  669    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000191587  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2470  hypothetical protein  60.16 
 
 
620 aa  751    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000205608  hitchhiker  0.00654791 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2607  hypothetical protein  91.98 
 
 
608 aa  1129    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000464347  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1635  hypothetical protein  83.33 
 
 
609 aa  1060    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0185934  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1815  hypothetical protein  57.17 
 
 
617 aa  686    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000383708  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2567  hypothetical protein  100 
 
 
611 aa  1249    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00371664  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1603  hypothetical protein  62.4 
 
 
625 aa  742    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00349835  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1604  hypothetical protein  82.49 
 
 
607 aa  1021    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000915226  normal  0.134718 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2658  hypothetical protein  58.8 
 
 
629 aa  731    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.142144  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1610  hypothetical protein  82.16 
 
 
608 aa  1026    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.179059  normal  0.203284 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1543  hypothetical protein  80.85 
 
 
608 aa  1018    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0643256  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2467  hypothetical protein  58.4 
 
 
624 aa  743    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000132009  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2007  hypothetical protein  29.1 
 
 
565 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0554485  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3276  hypothetical protein  28.52 
 
 
613 aa  122  1.9999999999999998e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1429  hypothetical protein  27.06 
 
 
576 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0373606  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2280  hypothetical protein  23.26 
 
 
612 aa  45.8  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0821111  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>