18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_3527 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_3527  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  100 
 
 		 187 aa  372  1e-102  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000711222 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3719  OmpA domain-containing protein  98.93 
 
 		 187 aa  367  1e-101  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3596  OmpA domain-containing protein  98.93 
 
 		 187 aa  369  1e-101  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.863386  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0715  OmpA-like transmembrane domain-containing protein  97.86 
 
 		 187 aa  365  1e-100  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3810  OmpA-like transmembrane domain-containing protein  77.01 
 
 		 187 aa  303  1.0000000000000001e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3151  OmpA domain-containing protein  85.45 
 
 		 167 aa  293  7e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0816  OmpA domain-containing protein  85.45 
 
 		 167 aa  293  7e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0787  OmpA-like transmembrane domain-containing protein  85.45 
 
 		 167 aa  292  2e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0823  OmpA domain-containing protein  75 
 
 		 191 aa  285  4e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.961285  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3630  OmpA-like transmembrane domain-containing protein  49.73 
 
 		 187 aa  190  9e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.229137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3437  OmpA-like transmembrane domain-containing protein  48.09 
 
 		 187 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2552  OmpA-like transmembrane domain-containing protein  44.86 
 
 		 186 aa  174  6e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.508758 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3640  OmpA domain-containing protein  48.66 
 
 		 190 aa  167  7e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.750133  normal  0.334713 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000761  OmpA-like transmembrane domain protein  39.53 
 
 		 183 aa  119  1.9999999999999998e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04884  hypothetical protein  37.32 
 
 		 149 aa  88.6  5e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3816  OmpA domain-containing protein  31.79 
 
 		 180 aa  68.9  0.00000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.549731  normal  0.0255224 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0698  hypothetical protein  27.78 
 
 		 183 aa  64.7  0.0000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000691  putative outer membrane protein  28.64 
 
 		 204 aa  43.1  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>