56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_3258 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_3258  hypothetical protein  100 
 
 
217 aa  457  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.077733 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1100  hypothetical protein  99.08 
 
 
217 aa  453  1e-127  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1134  hypothetical protein  99.08 
 
 
217 aa  453  1e-127  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1033  hypothetical protein  99.08 
 
 
217 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.935593  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2978  hypothetical protein  91.04 
 
 
205 aa  391  1e-108  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.294635  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3060  hypothetical protein  91.54 
 
 
205 aa  393  1e-108  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.272775  normal  0.469767 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3158  hypothetical protein  91.5 
 
 
205 aa  392  1e-108  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.191231  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3557  hypothetical protein  89.22 
 
 
205 aa  387  1e-107  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1038  hypothetical protein  87.32 
 
 
205 aa  384  1e-106  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1229  hypothetical protein  82.93 
 
 
205 aa  368  1e-101  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1331  hypothetical protein  82.84 
 
 
205 aa  362  2e-99  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.131922 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1074  hypothetical protein  82.83 
 
 
205 aa  356  1.9999999999999998e-97  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1210  hypothetical protein  79.51 
 
 
205 aa  355  2.9999999999999997e-97  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3324  hypothetical protein  84.29 
 
 
205 aa  354  5.999999999999999e-97  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109882 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1060  hypothetical protein  85.03 
 
 
203 aa  349  2e-95  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1221  hypothetical protein  79.68 
 
 
228 aa  326  1.0000000000000001e-88  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4077  putative lipoprotein  68.5 
 
 
206 aa  293  2e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.364574  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3372  putative lipoprotein  69.61 
 
 
204 aa  290  2e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1367  putative lipoprotein  67.68 
 
 
218 aa  285  5e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02762  putative lipoprotein  66 
 
 
212 aa  256  2e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0691373  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3012  transcriptional regulatory protein  59.78 
 
 
198 aa  242  3e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2633  hypothetical protein  54.9 
 
 
206 aa  223  1e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002531  hypothetical protein  53.19 
 
 
188 aa  213  1.9999999999999998e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03485  hypothetical protein  51.61 
 
 
187 aa  207  1e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0644  putative lipoprotein  50.26 
 
 
199 aa  199  3.9999999999999996e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2668  hypothetical protein  46.03 
 
 
192 aa  182  4.0000000000000006e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0580276  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1944  hypothetical protein  46.28 
 
 
215 aa  181  6e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0808013  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1365  hypothetical protein  46.11 
 
 
198 aa  179  2e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0430  putative lipoprotein  45.45 
 
 
192 aa  179  4e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1361  hypothetical protein  45.6 
 
 
198 aa  177  7e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3447  putative lipoprotein  44.44 
 
 
197 aa  177  1e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.002618  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0062  hypothetical protein  47.43 
 
 
195 aa  175  5e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0191236  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2832  transcriptional regulatory protein  43.43 
 
 
231 aa  175  6e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000741342  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2230  hypothetical protein  43.22 
 
 
210 aa  172  3.9999999999999995e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0147  hypothetical protein  43.52 
 
 
193 aa  170  1e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.126883 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1496  hypothetical protein  43.52 
 
 
193 aa  170  1e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2902  hypothetical protein  43.01 
 
 
193 aa  168  5e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.767422  normal  0.40239 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1882  transcriptional regulatory protein  49.49 
 
 
204 aa  167  8e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.622701  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0984  hypothetical protein  42.86 
 
 
218 aa  167  1e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00101229  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2173  hypothetical protein  41.99 
 
 
234 aa  161  9e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0780723  normal  0.253338 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0068  lipoprotein  47.06 
 
 
194 aa  160  1e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000291944 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1048  hypothetical protein  42.62 
 
 
248 aa  156  2e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0710  putative lipoprotein  42.86 
 
 
189 aa  155  6e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.147777  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0021  hypothetical protein  40.11 
 
 
212 aa  150  1e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2885  hypothetical protein  40.21 
 
 
209 aa  147  1.0000000000000001e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0501836  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2157  hypothetical protein  39.57 
 
 
212 aa  147  1.0000000000000001e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.563893  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1984  lytic transglycosylase catalytic  40.43 
 
 
194 aa  145  3e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1205  putative lipoprotein  40.96 
 
 
194 aa  142  3e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1168  putative lipoprotein  40.43 
 
 
194 aa  142  5e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0748418  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0204  hypothetical protein  39.89 
 
 
193 aa  141  8e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1317  putative lipoprotein  38.33 
 
 
196 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0234  hypothetical protein  39.89 
 
 
193 aa  139  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1881  hypothetical protein  40.68 
 
 
190 aa  134  9.999999999999999e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3587  hypothetical protein  41.48 
 
 
194 aa  130  2.0000000000000002e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.503233  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2221  putative transmembrane protein  39.89 
 
 
189 aa  128  8.000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.860046  normal  0.348957 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0717  peptidase M23B  31.68 
 
 
541 aa  43.9  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>