20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_1777 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_1854  hypothetical protein  83.28 
 
 
610 aa  1033    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1777  hypothetical protein  100 
 
 
608 aa  1243    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00185901  hitchhiker  0.000156228 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2146  hypothetical protein  54.9 
 
 
637 aa  689    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00198239  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2682  hypothetical protein  100 
 
 
608 aa  1243    Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000455476  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1949  hypothetical protein  57.74 
 
 
618 aa  695    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000191587  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2470  hypothetical protein  61.82 
 
 
620 aa  782    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000205608  hitchhiker  0.00654791 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2607  hypothetical protein  99.84 
 
 
608 aa  1239    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000464347  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1635  hypothetical protein  83.58 
 
 
609 aa  1064    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0185934  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1815  hypothetical protein  59.11 
 
 
617 aa  713    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000383708  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2567  hypothetical protein  92.14 
 
 
611 aa  1133    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00371664  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1603  hypothetical protein  64.47 
 
 
625 aa  775    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00349835  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1604  hypothetical protein  87.5 
 
 
607 aa  1081    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000915226  normal  0.134718 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2658  hypothetical protein  60.95 
 
 
629 aa  763    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.142144  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1610  hypothetical protein  86.51 
 
 
608 aa  1084    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.179059  normal  0.203284 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1543  hypothetical protein  85.2 
 
 
608 aa  1072    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0643256  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2467  hypothetical protein  58.81 
 
 
624 aa  749    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000132009  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2007  hypothetical protein  29.87 
 
 
565 aa  147  5e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0554485  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3276  hypothetical protein  29.87 
 
 
613 aa  135  1.9999999999999998e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1429  hypothetical protein  26.78 
 
 
576 aa  124  4e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0373606  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2280  hypothetical protein  22.49 
 
 
612 aa  45.1  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0821111  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>