32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_0234 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_0234  formate dehydrogenase region TAT target  100 
 
 		 65 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00376075 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4223  formate dehydrogenase region TAT target  100 
 
 		 65 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235438 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4105  formate dehydrogenase region TAT target  98.46 
 
 		 65 aa  130  6.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4135  hypothetical protein  98.46 
 
 		 65 aa  130  6.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.964966  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4508  hypothetical protein  86.15 
 
 		 65 aa  93.2  1e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3915  hypothetical protein  86.15 
 
 		 65 aa  93.2  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3790  twin-arginine translocation pathway signal  86.15 
 
 		 65 aa  90.9  5e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.973838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3719  twin-arginine translocation pathway signal  84.62 
 
 		 65 aa  89.4  1e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0338  hypothetical protein  83.08 
 
 		 76 aa  89  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4422  twin-arginine translocation pathway signal  69.23 
 
 		 66 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4814  formate dehydrogenase region TAT target  66.15 
 
 		 65 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.668008 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0056  twin-arginine translocation pathway signal  73.02 
 
 		 65 aa  65.1  0.0000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0334  twin-arginine translocation pathway signal  46.97 
 
 		 66 aa  58.5  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0058  twin-arginine translocation pathway signal  69.84 
 
 		 66 aa  58.2  0.00000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0062  hypothetical protein  42.86 
 
 		 65 aa  57  0.00000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4227  formate dehydrogenase region TAT target  42.42 
 
 		 66 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00210413 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4139  hypothetical protein  42.42 
 
 		 66 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0230  formate dehydrogenase region TAT target  42.42 
 
 		 66 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.202106 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4109  formate dehydrogenase region TAT target  42.42 
 
 		 66 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3610  hypothetical protein  43.08 
 
 		 64 aa  53.5  0.0000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3794  twin-arginine translocation pathway signal  47.83 
 
 		 66 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4138  formate dehydrogenase region TAT target  58.46 
 
 		 66 aa  52.4  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3723  twin-arginine translocation pathway signal  47.83 
 
 		 66 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3919  hypothetical protein  47.83 
 
 		 66 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.768927 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4418  hypothetical protein  41.27 
 
 		 65 aa  50.4  0.000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4810  formate dehydrogenase region TAT target  38.1 
 
 		 65 aa  48.5  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.202852 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4134  formate dehydrogenase region TAT target  36.51 
 
 		 65 aa  47.4  0.00006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4130  formate dehydrogenase region TAT target  36.51 
 
 		 65 aa  47  0.00009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1452  hypothetical protein  50.77 
 
 		 65 aa  45.4  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3614  hypothetical protein  41.54 
 
 		 64 aa  45.4  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4512  hypothetical protein  47.83 
 
 		 66 aa  43.5  0.0009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1121  hypothetical protein  43.08 
 
 		 65 aa  40.4  0.008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>