21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_4227 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_0230  formate dehydrogenase region TAT target  100 
 
 		 66 aa  130  6.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.202106 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4227  formate dehydrogenase region TAT target  100 
 
 		 66 aa  130  6.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00210413 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4139  hypothetical protein  100 
 
 		 66 aa  130  6.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4109  formate dehydrogenase region TAT target  98.48 
 
 		 66 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3723  twin-arginine translocation pathway signal  92.42 
 
 		 66 aa  120  7e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3919  hypothetical protein  92.42 
 
 		 66 aa  120  7e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.768927 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3794  twin-arginine translocation pathway signal  92.42 
 
 		 66 aa  120  7e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0334  twin-arginine translocation pathway signal  87.88 
 
 		 66 aa  114  5e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4512  hypothetical protein  90.91 
 
 		 66 aa  99  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4130  formate dehydrogenase region TAT target  76.56 
 
 		 65 aa  94  7e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4418  hypothetical protein  69.7 
 
 		 65 aa  91.3  4e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4134  formate dehydrogenase region TAT target  73.44 
 
 		 65 aa  90.5  7e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0062  hypothetical protein  69.7 
 
 		 65 aa  89  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4810  formate dehydrogenase region TAT target  66.67 
 
 		 65 aa  87.8  5e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.202852 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3610  hypothetical protein  49.23 
 
 		 64 aa  61.2  0.000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4422  twin-arginine translocation pathway signal  54.55 
 
 		 66 aa  53.1  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4814  formate dehydrogenase region TAT target  50 
 
 		 65 aa  48.5  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.668008 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0058  twin-arginine translocation pathway signal  50 
 
 		 66 aa  43.9  0.0007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0338  hypothetical protein  46.97 
 
 		 76 aa  42.4  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4138  formate dehydrogenase region TAT target  48.48 
 
 		 66 aa  42.7  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1121  hypothetical protein  43.08 
 
 		 65 aa  40.4  0.009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>