30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_4180 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_0306  hypothetical protein  83.5 
 
 
503 aa  901    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3984  hypothetical protein  97.26 
 
 
548 aa  1114    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0379  hypothetical protein  59.08 
 
 
543 aa  682    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4180  hypothetical protein  100 
 
 
548 aa  1137    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0276  hypothetical protein  61.02 
 
 
561 aa  696    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4221  hypothetical protein  65.49 
 
 
517 aa  710    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.256943 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4062  hypothetical protein  98.54 
 
 
548 aa  1125    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3685  hypothetical protein  79.78 
 
 
549 aa  950    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0230  hypothetical protein  60.53 
 
 
569 aa  706    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.769697  normal  0.583487 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4093  hypothetical protein  97.08 
 
 
548 aa  1116    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.245434  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3877  hypothetical protein  83.76 
 
 
546 aa  969    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.413132  normal  0.0515255 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0393  hypothetical protein  60.93 
 
 
559 aa  663    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0272  hypothetical protein  83.76 
 
 
546 aa  968    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3673  hypothetical protein  83.58 
 
 
546 aa  966    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3352  hypothetical protein  62.27 
 
 
546 aa  695    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3442  hypothetical protein  59.16 
 
 
550 aa  668    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.325746  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0927  hypothetical protein  36.92 
 
 
608 aa  305  1.0000000000000001e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.943956  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0256  hypothetical protein  29.33 
 
 
560 aa  192  2e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.17253  normal  0.370888 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0286  hypothetical protein  26.94 
 
 
546 aa  181  2.9999999999999997e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000399443  hitchhiker  0.00000302702 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1656  hypothetical protein  27.6 
 
 
627 aa  62.4  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.558221  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2958  hypothetical protein  27.71 
 
 
609 aa  61.6  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.725385  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0364  hypothetical protein  22.79 
 
 
683 aa  59.3  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.614436  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4071  hypothetical protein  32.08 
 
 
640 aa  56.6  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.184175  normal  0.0840228 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0339  hypothetical protein  28.04 
 
 
639 aa  48.1  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.809143 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2475  hypothetical protein  23.58 
 
 
611 aa  48.1  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.641856  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0638  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.04 
 
 
829 aa  46.6  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.1817 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1531  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.5 
 
 
857 aa  45.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.511204  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0295  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.01 
 
 
855 aa  44.3  0.006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.970191 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3837  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.85 
 
 
821 aa  44.3  0.006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0133754 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4431  surface antigen (D15)  25.47 
 
 
834 aa  43.5  0.009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.35545  hitchhiker  0.00645464 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>