47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E4772 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_3663  SdiA-regulated domain protein  98.45 
 
 		 323 aa  656    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000154748  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04165  hypothetical protein  98.45 
 
 		 322 aa  653    Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00151161  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4772  conserved hypothetical protein yjiK  100 
 
 		 323 aa  662    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4561  hypothetical protein  99.38 
 
 		 323 aa  656    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04202  hypothetical protein  98.45 
 
 		 322 aa  653    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00228683  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4933  hypothetical protein  96.59 
 
 		 323 aa  615  1e-175  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3731  SdiA-regulated domain-containing protein  99.3 
 
 		 286 aa  585  1e-166  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00663861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4878  SdiA-regulated protein  79.3 
 
 		 329 aa  494  1e-139  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.60346 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5845  SdiA-regulated protein  82.86 
 
 		 280 aa  478  1e-134  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.539509 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0418  hypothetical protein  31.54 
 
 		 321 aa  156  4e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0314  SdiA-regulated domain-containing protein  30.07 
 
 		 303 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.183725 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5204  SdiA-regulated domain-containing protein  30.63 
 
 		 300 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4658  hypothetical protein  36.33 
 
 		 301 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04270  putative transcriptional regulator  31.54 
 
 		 321 aa  154  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.510674  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4706  SdiA-regulated family protein  36.33 
 
 		 286 aa  154  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4573  sdiA-regulated family protein  36.33 
 
 		 286 aa  154  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4566  hypothetical protein  36.33 
 
 		 301 aa  154  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.859711  normal  0.266567 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4657  hypothetical protein  36.33 
 
 		 301 aa  154  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22840  SdiA-regulated domain-containing protein  32.44 
 
 		 308 aa  152  5e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0239521  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5058  SdiA-regulated domain-containing protein  30.63 
 
 		 300 aa  152  5e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0993064  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5151  SdiA-regulated domain protein  30.63 
 
 		 300 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.965879  normal  0.786945 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4227  SdiA-regulated domain-containing protein  31.99 
 
 		 303 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3272  SdiA-regulated protein  32.16 
 
 		 325 aa  143  4e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4588  SrgB  35.17 
 
 		 282 aa  143  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.537966  normal  0.854638 
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0044  SrgB  35.17 
 
 		 282 aa  143  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.880775 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4679  hypothetical protein  34.75 
 
 		 282 aa  142  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4848  SdiA-regulated  31.75 
 
 		 317 aa  142  8e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5383  SdiA-regulated  31.89 
 
 		 305 aa  142  8e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.02449 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5290  hypothetical protein  32.94 
 
 		 312 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.842454  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38420  hypothetical protein  31.68 
 
 		 309 aa  140  3e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.224716 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07110  hypothetical protein  28.57 
 
 		 317 aa  134  3e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.187526  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4229  SdiA-regulated domain-containing protein  30.2 
 
 		 317 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4849  SdiA-regulated  28.43 
 
 		 314 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5110  SdiA-regulated  29.77 
 
 		 326 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5082  sdiA-regulated domain protein  34.35 
 
 		 272 aa  119  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.142061 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48290  hypothetical protein  30.87 
 
 		 305 aa  119  6e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5291  hypothetical protein  28.52 
 
 		 310 aa  119  9e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0412  putatitve transcriptional regulator  30.57 
 
 		 310 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.470848  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5589  hypothetical protein  28.23 
 
 		 326 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04160  putatitve transcriptional regulator  30.19 
 
 		 329 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5059  SdiA-regulated domain-containing protein  29.34 
 
 		 306 aa  109  6e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.181452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5384  SdiA-regulated  29.1 
 
 		 307 aa  105  7e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0252012 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0313  SdiA-regulated domain-containing protein  28.29 
 
 		 306 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.124016 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5152  SdiA-regulated domain protein  29.18 
 
 		 306 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.767361 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5205  SdiA-regulated domain-containing protein  28.4 
 
 		 305 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.520929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2428  hypothetical protein  28.62 
 
 		 302 aa  99.8  5e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0451472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1385  putative extracellular nuclease  18.91 
 
 		 751 aa  48.5  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.14292  normal  0.827149 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>