52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_A0088 on replicon NC_010660
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010660  SbBS512_A0088  transposase  100 
 
 		 55 aa  110  6e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.310139  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2356  transposase mutator type  90.38 
 
 		 402 aa  94.7  3e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2007  transposase mutator type  90.38 
 
 		 402 aa  94.7  3e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.715039  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1493  transposase mutator type  90.38 
 
 		 402 aa  94.7  3e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0238  transposase mutator type  90.38 
 
 		 402 aa  94.7  3e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2337  IS285 transposase  90.38 
 
 		 402 aa  94  7e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000509727  normal  0.0644428 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0291  IS285, transposase  90.38 
 
 		 402 aa  94  7e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0178576  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2370  IS285 transposase  90.38 
 
 		 402 aa  94  7e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.284063 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2551  IS285 transposase  90.38 
 
 		 402 aa  94  7e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.554053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2640  IS285 transposase  90.38 
 
 		 402 aa  94  7e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.989951  normal  0.230148 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2690  IS285 transposase  90.38 
 
 		 402 aa  94  7e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.1618  normal  0.0882844 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2692  IS285 transposase  90.38 
 
 		 402 aa  94  7e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0200567  normal  0.0604339 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2822  IS285 transposase  90.38 
 
 		 402 aa  94  7e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0900869 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2868  IS285 transposase  90.38 
 
 		 402 aa  94  7e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2902  IS285 transposase  90.38 
 
 		 402 aa  94  7e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000738457  normal  0.356669 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3007  IS285 transposase  90.38 
 
 		 402 aa  94  7e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000643247  hitchhiker  0.00100345 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3508  IS285 transposase  90.38 
 
 		 402 aa  94  7e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0195612  normal  0.0648986 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4091  IS285 transposase  90.38 
 
 		 402 aa  94  7e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4124  IS285 transposase  90.38 
 
 		 402 aa  94  7e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.410453  normal  0.412793 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0427  transposase mutator type  90.38 
 
 		 402 aa  94  7e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00329499  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1806  transposase mutator type  90.38 
 
 		 402 aa  94  7e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.337522  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3068  transposase mutator type  90.38 
 
 		 402 aa  94  7e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4201  transposase mutator type  90.38 
 
 		 402 aa  94  7e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.102983  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0610  IS285 transposase  90.38 
 
 		 402 aa  94  7e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0069093  normal  0.361449 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0015  IS285, transposase  90.38 
 
 		 402 aa  94  7e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000501092  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0113  IS256 family transposase  90.38 
 
 		 402 aa  94  7e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  7.859819999999999e-35  hitchhiker  3.4908100000000004e-107 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0017  IS285 transposase  90.38 
 
 		 402 aa  94  7e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0178633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0144  IS285 transposase  90.38 
 
 		 402 aa  94  7e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.278135  hitchhiker  0.0000241688 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0184  IS285 transposase  90.38 
 
 		 402 aa  94  7e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000394328  hitchhiker  0.000122824 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0209  IS285 transposase  90.38 
 
 		 402 aa  94  7e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.976414 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0400  IS285 transposase  90.38 
 
 		 402 aa  94  7e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.104694 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0404  IS285 transposase  90.38 
 
 		 402 aa  94  7e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0078485 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0563  IS285 transposase  90.38 
 
 		 402 aa  94  7e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2328  IS285 transposase  90.38 
 
 		 402 aa  94  7e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0755498  normal  0.441869 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0878  IS285 transposase  90.38 
 
 		 402 aa  94  7e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.601324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2188  IS285 transposase  90.38 
 
 		 402 aa  94  7e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.49748 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1244  IS285 transposase  90.38 
 
 		 402 aa  94  7e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000000250762  hitchhiker  0.0000000000571449 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1704  IS285 transposase  90.38 
 
 		 402 aa  94  7e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0510914  hitchhiker  0.000569964 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1891  IS285 transposase  90.38 
 
 		 402 aa  94  7e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.940968  hitchhiker  0.000645661 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1925  IS285 transposase  90.38 
 
 		 402 aa  94  7e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.124366  normal  0.380546 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1936  IS285 transposase  90.38 
 
 		 402 aa  94  7e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.912598  normal  0.504152 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2169  IS285 transposase  90.38 
 
 		 402 aa  94  7e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0142554 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0899  IS285 transposase  90.38 
 
 		 402 aa  94  7e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0200567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2146  IS285 transposase  90.38 
 
 		 402 aa  94  7e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0965299  normal  0.0604339 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2292  transposase mutator type  90.38 
 
 		 286 aa  93.2  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0121086  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2585  IS285 transposase  88.46 
 
 		 402 aa  92.8  1e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000265507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3088  IS285 transposase  88.46 
 
 		 402 aa  92.8  1e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1807  transposase  90.38 
 
 		 63 aa  92.8  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.473053  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2496  transposase  89.13 
 
 		 49 aa  79  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.202641  hitchhiker  0.0000545248 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0005  IS1414, transposase  63.64 
 
 		 402 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0682409  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2225  transposase  59.62 
 
 		 140 aa  65.5  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.217285  hitchhiker  0.00000000170643 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0077  IS1414, transposase, truncation  60 
 
 		 94 aa  66.2  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.829264  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>