15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3972 on replicon NC_009426
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009426  Saro_3972  PilT domain-containing protein  100 
 
 		 129 aa  249  1e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2593  PilT protein-like protein  81.4 
 
 		 129 aa  170  6.999999999999999e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5644  PilT protein domain protein  43.41 
 
 		 129 aa  100  6e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1729  PilT protein-like  38.76 
 
 		 127 aa  92.8  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2840  PilT protein-like  42.06 
 
 		 131 aa  72.4  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0232573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4672  PilT protein-like  40.6 
 
 		 128 aa  72  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.108037 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1566  PilT protein domain protein  37.4 
 
 		 126 aa  63.9  0.0000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3354  PilT protein domain protein  41.74 
 
 		 122 aa  60.5  0.000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.593845  normal  0.0124414 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3323  hypothetical protein  36.84 
 
 		 124 aa  60.8  0.000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.479651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0408  PilT domain-containing protein  34.35 
 
 		 136 aa  52.4  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000108029  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0195  PilT protein-like  30.15 
 
 		 146 aa  51.6  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3732  PilT protein domain protein  37.39 
 
 		 129 aa  49.7  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0344476 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2426  PilT domain-containing protein  28.12 
 
 		 137 aa  44.7  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2726  PilT protein domain protein  27.01 
 
 		 131 aa  42  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0340205  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0633  PilT domain-containing protein  33.61 
 
 		 142 aa  40  0.01  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>