16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3214 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_3214  hypothetical protein  100 
 
 
154 aa  307  4e-83  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3021  hypothetical protein  85.83 
 
 
153 aa  214  2.9999999999999998e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2853  hypothetical protein  67.65 
 
 
197 aa  185  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.140453  normal  0.0482245 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2956  hypothetical protein  60.4 
 
 
164 aa  124  5e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1281  hypothetical protein  52.73 
 
 
188 aa  120  7e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.864029 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5031  hypothetical protein  54.46 
 
 
170 aa  120  9e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.336697 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3632  hypothetical protein  51.49 
 
 
201 aa  113  7.999999999999999e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0636  hypothetical protein  37.18 
 
 
175 aa  113  1.0000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.248742 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2051  hypothetical protein  42.31 
 
 
182 aa  101  4e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.547362  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0412  hypothetical protein  40.59 
 
 
160 aa  66.2  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3134  hypothetical protein  35.51 
 
 
184 aa  66.2  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.408769  hitchhiker  0.0000561841 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2499  hypothetical protein  38.24 
 
 
178 aa  62.8  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0623161  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0044  hypothetical protein  40.2 
 
 
156 aa  59.7  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000485186 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2764  hypothetical protein  41.58 
 
 
169 aa  53.5  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0046  hypothetical protein  40.2 
 
 
162 aa  50.1  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.185618 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0841  hypothetical protein  37.14 
 
 
208 aa  47  0.00009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.162645  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>