35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2959 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_2959  toxic anion resistance  100 
 
 
415 aa  840    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.982902  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0261  toxic anion resistance family protein  72.99 
 
 
395 aa  585  1e-166  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.343887  normal  0.0699835 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2308  toxic anion resistance  71 
 
 
403 aa  572  1.0000000000000001e-162  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0765  toxic anion resistance family protein  56.42 
 
 
414 aa  412  1e-114  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3316  toxic anion resistance family protein  53.69 
 
 
420 aa  399  9.999999999999999e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0717887 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2138  toxic anion resistance family protein  49.74 
 
 
417 aa  393  1e-108  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00290254  hitchhiker  0.00275105 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2100  hypothetical protein  49.48 
 
 
414 aa  393  1e-108  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00242113  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2419  toxic anion resistance  48.96 
 
 
414 aa  390  1e-107  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0839824  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1633  hypothetical protein  48.67 
 
 
406 aa  370  1e-101  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2919  toxic anion resistance  47.47 
 
 
419 aa  361  1e-98  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.220942  normal  0.0480971 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3058  toxic anion resistance family protein  49.49 
 
 
405 aa  355  6.999999999999999e-97  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000145749 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3213  hypothetical protein  50.65 
 
 
384 aa  350  3e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0446815  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3025  toxic anion resistance family protein  45.77 
 
 
407 aa  338  1.9999999999999998e-91  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00868928  hitchhiker  0.000634734 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6387  toxic anion resistance family protein  49.73 
 
 
409 aa  332  9e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.550341  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0931  toxic anion resistance  44.62 
 
 
406 aa  323  3e-87  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.224852  normal  0.413842 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37530  uncharacterized protein involved in tellurite resistance  45.27 
 
 
399 aa  323  4e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.319734  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00690  uncharacterized protein involved in tellurite resistance  37.53 
 
 
407 aa  237  3e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0312  hypothetical protein  32.69 
 
 
424 aa  233  4.0000000000000004e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.722745 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2217  hypothetical protein  32.56 
 
 
394 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.111747 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3493  toxic anion resistance family protein  35.19 
 
 
405 aa  186  7e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.603001  normal  0.405546 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4059  toxic anion resistance family protein  33.67 
 
 
406 aa  180  4.999999999999999e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1518  toxic anion resistance family protein  34.22 
 
 
412 aa  176  9e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.150292  normal  0.25035 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2555  hypothetical protein  25 
 
 
370 aa  110  5e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.588828  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2475  hypothetical protein  25 
 
 
370 aa  110  6e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2414  hypothetical protein  25.53 
 
 
370 aa  108  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2266  toxic anion resistance family protein  25.27 
 
 
387 aa  108  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0678634  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2916  hypothetical protein  25.53 
 
 
387 aa  108  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.233445 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1786  toxic anion resistance family protein  25.43 
 
 
369 aa  107  3e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2287  hypothetical protein  25.43 
 
 
358 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0180741  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2250  hypothetical protein  25.43 
 
 
358 aa  105  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00532335  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2208  hypothetical protein  25.43 
 
 
358 aa  105  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0466629  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2458  hypothetical protein  25.43 
 
 
358 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2491  hypothetical protein  25.14 
 
 
358 aa  104  3e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000702786  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1941  toxic anion resistance family protein  20.99 
 
 
365 aa  52.8  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.969039  normal  0.0249977 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1929  toxic anion resistance  27.13 
 
 
396 aa  43.5  0.008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.414661  normal  0.613644 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>