19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1168 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1168  carotene hydroxylase  100 
 
 		 176 aa  353  6.999999999999999e-97  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2128  carotene hydroxylase  80 
 
 		 200 aa  285  2e-76  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.287054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4535  carotene hydroxylase  53.7 
 
 		 168 aa  174  4e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.179173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2665  fatty acid hydroxylase  48.1 
 
 		 155 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5702  fatty acid hydroxylase  43.48 
 
 		 158 aa  127  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.733403 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1710  fatty acid hydroxylase  47.33 
 
 		 157 aa  126  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0174617  normal  0.199306 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2516  carotene hydroxylase  48.73 
 
 		 155 aa  125  3e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3246  beta-carotene hydroxylase  48.73 
 
 		 155 aa  124  5e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0059  carotene hydroxylase  42.76 
 
 		 146 aa  113  1.0000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5618  fatty acid hydroxylase  43.71 
 
 		 158 aa  113  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2647  fatty acid hydroxylase  46.41 
 
 		 176 aa  112  3e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.810487  normal  0.467325 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2033  fatty acid hydroxylase  44.53 
 
 		 158 aa  104  8e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2038  beta-carotene hydroxylase  39.44 
 
 		 155 aa  102  3e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0223903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2089  fatty acid hydroxylase  41.84 
 
 		 152 aa  100  7e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.213926  normal  0.0390398 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00925  beta carotene hydroxylase  43.54 
 
 		 150 aa  90.1  1e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0820684  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0702  fatty acid hydroxylase  38.97 
 
 		 151 aa  85.1  5e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0482  fatty acid hydroxylase  37.34 
 
 		 153 aa  82.4  0.000000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1074  carotene hydroxylase  35.71 
 
 		 157 aa  79.3  0.00000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_9013  predicted protein  35.64 
 
 		 153 aa  57.8  0.00000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0252602  normal  0.0220603 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>