18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0829 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_0829  hypothetical protein  100 
 
 
261 aa  511  1e-144  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4220  hypothetical protein  35.9 
 
 
249 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.596689 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1691  hypothetical protein  33.99 
 
 
281 aa  118  7.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1227  hypothetical protein  35.47 
 
 
249 aa  113  3e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0996282  normal  0.630416 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1196  hypothetical protein  35.47 
 
 
251 aa  112  5e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.161366  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0772  hypothetical protein  31.1 
 
 
261 aa  102  7e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0620  hypothetical protein  31.1 
 
 
261 aa  102  7e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.228252  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1755  hypothetical protein  34.23 
 
 
230 aa  98.2  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.071754  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0203  hypothetical protein  27.95 
 
 
270 aa  77  0.0000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2020  hypothetical protein  25.85 
 
 
293 aa  74.7  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00123308  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2064  hypothetical protein  25.58 
 
 
296 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000220233 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2158  hypothetical protein  25.76 
 
 
296 aa  66.6  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0467  hypothetical protein  29.28 
 
 
293 aa  65.9  0.0000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.151068  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3413  hypothetical protein  24.38 
 
 
285 aa  62.4  0.000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0120615  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0908  hypothetical protein  27.76 
 
 
256 aa  58.9  0.00000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000303993  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2939  hypothetical protein  25.93 
 
 
290 aa  45.1  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000256783  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1059  hypothetical protein  28.85 
 
 
263 aa  43.5  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.269022  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2004  hypothetical protein  23.35 
 
 
266 aa  42.7  0.005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00153621  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>