23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_5100 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_5100  hypothetical protein  100 
 
 
221 aa  442  1e-123  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.333  hitchhiker  0.000000366045 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4582  hypothetical protein  92.76 
 
 
218 aa  406  1.0000000000000001e-112  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.466428  hitchhiker  0.0015101 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9378  hypothetical protein  74.29 
 
 
206 aa  323  9e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.744975  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3580  hypothetical protein  73.81 
 
 
205 aa  323  1e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.321771  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4974  hypothetical protein  73.33 
 
 
205 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7331  hypothetical protein  64.81 
 
 
212 aa  303  2.0000000000000002e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.268079 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4539  hypothetical protein  64.79 
 
 
212 aa  295  3e-79  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2151  GCN5-related N-acetyltransferase  69.19 
 
 
230 aa  285  4e-76  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7089  hypothetical protein  61.5 
 
 
210 aa  266  2e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.670641  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4505  hypothetical protein  60.28 
 
 
244 aa  245  4e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0109204 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39700  acetyltransferase (GNAT) family protein  60.91 
 
 
207 aa  243  1.9999999999999999e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6428  GCN5-related N-acetyltransferase  58.65 
 
 
204 aa  227  1e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4689  GCN5-related N-acetyltransferase  54.46 
 
 
224 aa  218  6e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.969792  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5404  hypothetical protein  44.86 
 
 
269 aa  185  4e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6070  hypothetical protein  41.1 
 
 
246 aa  168  5e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.790458  normal  0.16061 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13951  hypothetical protein  39.21 
 
 
244 aa  166  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0836  hypothetical protein  40.17 
 
 
249 aa  165  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.485389 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5494  hypothetical protein  40.43 
 
 
249 aa  162  3e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0743345  normal  0.20283 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5781  hypothetical protein  40.43 
 
 
249 aa  162  3e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.448544  normal  0.0206259 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5405  hypothetical protein  40.43 
 
 
249 aa  162  3e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4235  hypothetical protein  41.15 
 
 
239 aa  155  4e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4856  hypothetical protein  36.48 
 
 
261 aa  133  1.9999999999999998e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4189  GCN5-related N-acetyltransferase  29.94 
 
 
189 aa  47.8  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.815619  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>