32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_5047 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_5047  thiamineS protein  100 
 
 		 99 aa  194  3e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0107855 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4537  thiamineS protein  80.81 
 
 		 98 aa  135  1e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.708821 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4962  thiamineS protein  58.02 
 
 		 82 aa  90.1  8e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.806952  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0470  thiamineS protein  50 
 
 		 87 aa  74.3  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34170  molybdopterin converting factor, small subunit  48.19 
 
 		 103 aa  70.5  0.000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.176144  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1691  thiamineS protein  46.91 
 
 		 103 aa  67  0.00000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.319795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4752  thiamineS protein  46.67 
 
 		 100 aa  59.3  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4478  thiamineS  44.71 
 
 		 88 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.605033  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4565  thiamineS protein  44.71 
 
 		 88 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0626393 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4861  thiamineS protein  44.71 
 
 		 88 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0539176 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0445  thiamine S  43.18 
 
 		 97 aa  54.7  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2024  thiamineS protein  43.62 
 
 		 92 aa  53.9  0.0000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.930246  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0822  thiamineS protein  49.38 
 
 		 79 aa  52  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0182275  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0356  thiamineS protein  49.37 
 
 		 79 aa  52  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1754  thiamineS protein  43.37 
 
 		 94 aa  51.6  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.593582  hitchhiker  0.00626115 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5048  thiamineS protein  46.91 
 
 		 88 aa  50.8  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.501283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10885  molybdenum cofactor biosynthesis protein D 2 moaD2  42.7 
 
 		 92 aa  50.8  0.000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  3.91513e-26  normal  0.142298 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1704  thiamineS protein  46.91 
 
 		 82 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20020  hypothetical protein  50.6 
 
 		 79 aa  48.5  0.00003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00891223 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19310  molybdopterin converting factor, small subunit  45.45 
 
 		 79 aa  45.8  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0344734  normal  0.0247998 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1439  thiamineS protein  40.91 
 
 		 88 aa  45.8  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0227652  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3626  thiamineS protein  48.39 
 
 		 92 aa  44.7  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.014511  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8251  thiamineS protein  53.19 
 
 		 83 aa  43.9  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0159  molybdopterin converting factor, subunit 1  36.14 
 
 		 83 aa  43.5  0.0009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000222871  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1243  hypothetical protein  35.71 
 
 		 84 aa  43.5  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00015012  normal  0.456438 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2736  putative molybdopterin converting factor  37.76 
 
 		 102 aa  42.4  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0454  thiamineS protein  44.05 
 
 		 82 aa  41.6  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.132954  normal  0.504318 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1232  thiamine S protein  53.85 
 
 		 82 aa  41.6  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.895224  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0896  molybdopterin converting factor, subunit 1  43.21 
 
 		 83 aa  40.8  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08550  ThiS family protein  52.78 
 
 		 100 aa  40.8  0.007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.266586  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1443  thiamineS protein  39.77 
 
 		 88 aa  40.4  0.009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000277571 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4239  thiamineS protein  38.2 
 
 		 90 aa  40.4  0.009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.312253  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>