21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4627 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_4627  hypothetical protein  100 
 
 
125 aa  251  2.0000000000000002e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.377564  normal  0.0143753 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2759  hypothetical protein  63.79 
 
 
132 aa  152  1e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1583  hypothetical protein  36.89 
 
 
127 aa  76.3  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1744  hypothetical protein  37.7 
 
 
155 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.991206  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05337  hypothetical protein  38.4 
 
 
125 aa  76.6  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1527  hypothetical protein  35.25 
 
 
132 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.571164  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0089  hypothetical protein  35.25 
 
 
132 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.567246  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1151  hypothetical protein  35.25 
 
 
130 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0924  hypothetical protein  35.25 
 
 
199 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.391648  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2252  hypothetical protein  34.43 
 
 
132 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1009  hypothetical protein  34.43 
 
 
199 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.235357  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0845  hypothetical protein  35.4 
 
 
113 aa  63.5  0.0000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.205653 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7128  hypothetical protein  35.92 
 
 
135 aa  62.4  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4084  hypothetical protein  35.79 
 
 
123 aa  58.5  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.352089  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0439  hypothetical protein  28.45 
 
 
126 aa  53.5  0.0000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2092  hypothetical protein  28.45 
 
 
127 aa  50.1  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.496142  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1607  hypothetical protein  29.2 
 
 
122 aa  49.7  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.212586  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1132  hypothetical protein  27.97 
 
 
124 aa  48.5  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000107029  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1368  hypothetical protein  24.11 
 
 
122 aa  44.3  0.0005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2276  hypothetical protein  30.21 
 
 
126 aa  43.5  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1701  hypothetical protein  26.55 
 
 
127 aa  42.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>