8 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2950 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_2950  hypothetical protein  100 
 
 		 406 aa  820    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.291  normal  0.0162357 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4357  fatty acid desaturase  38.32 
 
 		 390 aa  232  1e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.211294  normal  0.345655 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6169  fatty acid desaturase  33.33 
 
 		 394 aa  201  9.999999999999999e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.88883  decreased coverage  0.00544471 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3443  fatty acid desaturase  35.21 
 
 		 376 aa  177  4e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0150707 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2445  hypothetical protein  28.76 
 
 		 308 aa  123  7e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.464364 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3390  hypothetical protein  23.51 
 
 		 424 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0816093  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2125  fatty acid desaturase  27.09 
 
 		 365 aa  46.2  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0362357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40020  hypothetical protein  21.72 
 
 		 424 aa  44.7  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>