30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1345 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_1345  hypothetical protein  100 
 
 
222 aa  432  1e-120  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.405691  decreased coverage  0.0000428453 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1387  hypothetical protein  77.03 
 
 
200 aa  309  2e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2234  hypothetical protein  41.52 
 
 
221 aa  120  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00687189 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0847  hypothetical protein  41.18 
 
 
170 aa  71.2  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14880  hypothetical protein  38.18 
 
 
155 aa  67.8  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0219247  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4717  hypothetical protein  40 
 
 
140 aa  65.5  0.0000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.729727  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3698  hypothetical protein  38.13 
 
 
141 aa  58.5  0.00000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.309374  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2011  hypothetical protein  36.19 
 
 
124 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.837589  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1885  hypothetical protein  41 
 
 
139 aa  57.4  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0572068  normal  0.900072 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4905  hypothetical protein  34.56 
 
 
140 aa  56.6  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.159227  hitchhiker  0.00546227 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11632  hypothetical protein  34.75 
 
 
132 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.079961 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3177  hypothetical protein  34.38 
 
 
171 aa  53.9  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.421028  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6425  hypothetical protein  30 
 
 
154 aa  51.6  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3029  hypothetical protein  38.55 
 
 
127 aa  50.4  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2222  hypothetical protein  33.07 
 
 
150 aa  50.8  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2938  hypothetical protein  37.86 
 
 
145 aa  50.8  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.904567 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0371  hypothetical protein  36.94 
 
 
145 aa  49.7  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.37992e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3594  hypothetical protein  34.07 
 
 
136 aa  48.9  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.32654  normal  0.529723 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3104  hypothetical protein  35.34 
 
 
137 aa  48.1  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3045  hypothetical protein  35.34 
 
 
137 aa  48.1  0.00009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3061  hypothetical protein  35.34 
 
 
137 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.130056  normal  0.220176 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0848  hypothetical protein  27.34 
 
 
136 aa  47.4  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.276759 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2821  hypothetical protein  33.66 
 
 
137 aa  45.1  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.650851  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1163  hypothetical protein  36.13 
 
 
154 aa  43.9  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.567834  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3461  hypothetical protein  30.11 
 
 
166 aa  43.1  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.239912  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5672  hypothetical protein  36.89 
 
 
124 aa  43.1  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0129  hypothetical protein  32.99 
 
 
139 aa  42.7  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0704993  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5433  hypothetical protein  35.85 
 
 
141 aa  42.4  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00625909  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2876  putative transmembrane protein  41.94 
 
 
142 aa  42  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000745882  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2592  hypothetical protein  41.86 
 
 
155 aa  41.6  0.01  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000455117  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>