20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0324 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_0324  hypothetical protein  100 
 
 
168 aa  341  2.9999999999999997e-93  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000675219 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0281  hypothetical protein  92.86 
 
 
168 aa  320  4e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0437865 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2379  hypothetical protein  44.76 
 
 
166 aa  114  5e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17636  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3604  protein of unknown function DUF402  40.12 
 
 
173 aa  99.4  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0611051  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3701  hypothetical protein  37.89 
 
 
167 aa  85.1  4e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.134012  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1004  hypothetical protein  36.54 
 
 
198 aa  77.8  0.00000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1639  hypothetical protein  32.54 
 
 
194 aa  73.9  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000840175 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1646  hypothetical protein  31.61 
 
 
186 aa  66.2  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.8191  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0673  hypothetical protein  26.58 
 
 
189 aa  54.3  0.0000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.413184  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0411  hypothetical protein  25.95 
 
 
177 aa  53.1  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1369  hypothetical protein  23.42 
 
 
204 aa  49.7  0.00002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000291159  hitchhiker  0.0000000113802 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1350  hypothetical protein  23.78 
 
 
178 aa  48.9  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0421  hypothetical protein  25.32 
 
 
177 aa  48.1  0.00005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0474  hypothetical protein  23.42 
 
 
177 aa  48.1  0.00005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00172302  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1055  hypothetical protein  24.05 
 
 
176 aa  47.8  0.00007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.195641  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1696  hypothetical protein  24.05 
 
 
184 aa  47  0.0001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1405  hypothetical protein  23.42 
 
 
180 aa  45.4  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1921  hypothetical protein  23.42 
 
 
180 aa  43.9  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1955  hypothetical protein  23.42 
 
 
180 aa  43.9  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0449  hypothetical protein  23.53 
 
 
176 aa  40.8  0.009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>