19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_3331 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008700  Sama_3331  hypothetical protein  100 
 
 
349 aa  701    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3675  acyltransferase 3  60.46 
 
 
345 aa  424  1e-117  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3865  acyltransferase 3  59.03 
 
 
345 aa  418  1e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00949933 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4165  acyltransferase 3  58.45 
 
 
345 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3970  acyltransferase 3  58.17 
 
 
345 aa  414  1e-114  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4047  acyltransferase 3  58.17 
 
 
345 aa  414  1e-114  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0291  acyltransferase 3  59.03 
 
 
345 aa  413  1e-114  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4078  acyltransferase 3  58.17 
 
 
345 aa  414  1e-114  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3653  acyltransferase 3  58.74 
 
 
345 aa  410  1e-113  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0320  hypothetical protein  57.52 
 
 
335 aa  389  1e-107  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0102  acyltransferase 3  42.49 
 
 
368 aa  256  5e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0248047  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1771  acyltransferase 3  31.69 
 
 
345 aa  154  2e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1158  acyltransferase 3  31.68 
 
 
385 aa  129  6e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00977171  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3659  hypothetical protein  30.19 
 
 
346 aa  119  7.999999999999999e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.421403 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2178  acyltransferase domain, membrane protein  28.8 
 
 
348 aa  82  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2797  acyltransferase 3  28.53 
 
 
363 aa  64.3  0.000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1380  hypothetical protein  25.23 
 
 
321 aa  58.2  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.786153 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3838  acyltransferase 3  21.95 
 
 
347 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1141  acyltransferase 3  25.83 
 
 
361 aa  45.1  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.283735  normal  0.618576 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>