16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_2456 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_2456  hypothetical protein  100 
 
 		 120 aa  254  3e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2939  hypothetical protein  76.67 
 
 		 124 aa  198  3e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1489  hypothetical protein  75 
 
 		 135 aa  197  6e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2763  hypothetical protein  75.83 
 
 		 124 aa  196  6e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.160666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2841  hypothetical protein  75.83 
 
 		 124 aa  196  7e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.126178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1243  hypothetical protein  74.17 
 
 		 123 aa  194  3e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1320  hypothetical protein  73.33 
 
 		 121 aa  193  8.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1311  hypothetical protein  73.33 
 
 		 121 aa  193  8.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1347  hypothetical protein  73.33 
 
 		 121 aa  193  8.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3039  hypothetical protein  73.33 
 
 		 121 aa  193  8.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2799  hypothetical protein  66.67 
 
 		 121 aa  175  2e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2579  hypothetical protein  67.23 
 
 		 128 aa  174  3e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1162  hypothetical protein  61.67 
 
 		 124 aa  165  2e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00416619 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1149  hypothetical protein  60.83 
 
 		 120 aa  161  2.0000000000000002e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1254  hypothetical protein  56.67 
 
 		 120 aa  157  4e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.588078 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1355  hypothetical protein  56.41 
 
 		 120 aa  153  1e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000473524 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>