16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_1311 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009052  Sbal_1320  hypothetical protein  100 
 
 
121 aa  258  2e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1311  hypothetical protein  100 
 
 
121 aa  258  2e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1347  hypothetical protein  100 
 
 
121 aa  258  2e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3039  hypothetical protein  100 
 
 
121 aa  258  2e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1243  hypothetical protein  97.52 
 
 
123 aa  253  5e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2763  hypothetical protein  92.56 
 
 
124 aa  243  6.999999999999999e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.160666  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2841  hypothetical protein  92.56 
 
 
124 aa  243  8e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.126178  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1489  hypothetical protein  91.74 
 
 
135 aa  241  3e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2939  hypothetical protein  90.91 
 
 
124 aa  239  7e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2799  hypothetical protein  77.69 
 
 
121 aa  209  1e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2579  hypothetical protein  78.99 
 
 
128 aa  205  2e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2456  hypothetical protein  73.33 
 
 
120 aa  193  8.000000000000001e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1162  hypothetical protein  70.25 
 
 
124 aa  191  2e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00416619 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1254  hypothetical protein  67.5 
 
 
120 aa  184  3e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.588078 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1355  hypothetical protein  67.5 
 
 
120 aa  184  5e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000473524 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1149  hypothetical protein  64.17 
 
 
120 aa  175  2e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>