16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_3021 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_3021  hypothetical protein  100 
 
 		 153 aa  301  2.0000000000000002e-81  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3214  hypothetical protein  79.7 
 
 		 154 aa  221  4e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2853  hypothetical protein  64.71 
 
 		 197 aa  178  2.9999999999999997e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.140453  normal  0.0482245 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5031  hypothetical protein  47.8 
 
 		 170 aa  128  4.0000000000000003e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.336697 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1281  hypothetical protein  47.26 
 
 		 188 aa  126  9.000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.864029 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3632  hypothetical protein  41.05 
 
 		 201 aa  124  3e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2956  hypothetical protein  57.94 
 
 		 164 aa  123  1e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0636  hypothetical protein  50 
 
 		 175 aa  116  9.999999999999999e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.248742 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2051  hypothetical protein  48.57 
 
 		 182 aa  105  2e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.547362  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0412  hypothetical protein  41.03 
 
 		 160 aa  70.1  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3134  hypothetical protein  41.18 
 
 		 184 aa  67  0.00000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.408769  hitchhiker  0.0000561841 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2499  hypothetical protein  39.22 
 
 		 178 aa  63.9  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0623161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0044  hypothetical protein  37.86 
 
 		 156 aa  58.2  0.00000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000485186 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2764  hypothetical protein  41.58 
 
 		 169 aa  54.7  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0046  hypothetical protein  42 
 
 		 162 aa  52  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.185618 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0841  hypothetical protein  36.47 
 
 		 208 aa  49.3  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.162645  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>