27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1294 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1294  hypothetical protein  100 
 
 
145 aa  293  4e-79  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0137379  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3765  hypothetical protein  35.21 
 
 
146 aa  90.5  7e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3329  hypothetical protein  34.75 
 
 
142 aa  87.8  5e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2149  hypothetical protein  32.85 
 
 
142 aa  85.5  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.167066  normal  0.288059 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4776  hypothetical protein  36.3 
 
 
145 aa  85.1  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00268249 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0342  hypothetical protein  35.07 
 
 
146 aa  82  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.881647 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1372  hypothetical protein  32.68 
 
 
161 aa  81.3  0.000000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2280  hypothetical protein  35.61 
 
 
142 aa  76.3  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3607  hypothetical protein  30.83 
 
 
141 aa  72.8  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.9799  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46310  hypothetical protein  29.71 
 
 
145 aa  71.2  0.000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.123911  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2092  hypothetical protein  31.3 
 
 
144 aa  68.2  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2467  hypothetical protein  28.57 
 
 
146 aa  68.6  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2135  hypothetical protein  33.1 
 
 
151 aa  67  0.00000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0076  hypothetical protein  30 
 
 
168 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3744  phosphoribosyltransferase-like protein  29.58 
 
 
418 aa  62.8  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.478029  normal  0.0623345 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13970  hypothetical protein  26.62 
 
 
211 aa  57.8  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.607556 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2062  hypothetical protein  28.12 
 
 
146 aa  56.2  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0457353  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0925  hypothetical protein  26.72 
 
 
118 aa  52  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1403  hypothetical protein  25.36 
 
 
141 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.628547  normal  0.692701 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0392  hypothetical protein  25.87 
 
 
149 aa  50.8  0.000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.2643  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3998  hypothetical protein  29.31 
 
 
137 aa  47.4  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2011  CBS domain-containing protein  31.36 
 
 
286 aa  47  0.00009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2265  hypothetical protein  28.36 
 
 
136 aa  46.6  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.210713  normal  0.0751956 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2121  hypothetical protein  26.87 
 
 
196 aa  45.8  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.277797  normal  0.0126504 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0380  hypothetical protein  26.27 
 
 
141 aa  43.5  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1903  hypothetical protein  33.33 
 
 
139 aa  43.5  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0401096  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3527  hypothetical protein  27.69 
 
 
145 aa  42.7  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>