21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0076 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_0076  hypothetical protein  100 
 
 
168 aa  335  9.999999999999999e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2135  hypothetical protein  56.83 
 
 
151 aa  163  1.0000000000000001e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3527  hypothetical protein  59.29 
 
 
145 aa  150  1e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1372  hypothetical protein  42.77 
 
 
161 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46310  hypothetical protein  41.79 
 
 
145 aa  106  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.123911  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2092  hypothetical protein  42.45 
 
 
144 aa  104  5e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3765  hypothetical protein  40.71 
 
 
146 aa  101  6e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2467  hypothetical protein  36.43 
 
 
146 aa  93.2  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4776  hypothetical protein  34.29 
 
 
145 aa  92.4  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00268249 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3607  hypothetical protein  36.43 
 
 
141 aa  88.2  5e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.9799  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0925  hypothetical protein  39.83 
 
 
118 aa  87  9e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0342  hypothetical protein  31.91 
 
 
146 aa  85.5  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.881647 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2280  hypothetical protein  32.86 
 
 
142 aa  81.6  0.000000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2062  hypothetical protein  39.23 
 
 
146 aa  77  0.0000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0457353  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1403  hypothetical protein  36.88 
 
 
141 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.628547  normal  0.692701 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13970  hypothetical protein  35.54 
 
 
211 aa  68.6  0.00000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.607556 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3329  hypothetical protein  31.88 
 
 
142 aa  67.8  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1294  hypothetical protein  30 
 
 
145 aa  65.5  0.0000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0137379  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2149  hypothetical protein  28.67 
 
 
142 aa  63.5  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.167066  normal  0.288059 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3744  phosphoribosyltransferase-like protein  31.69 
 
 
418 aa  63.9  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.478029  normal  0.0623345 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0392  hypothetical protein  32.82 
 
 
149 aa  60.8  0.000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.2643  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>