18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_3856 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_3856  hypothetical protein  100 
 
 		 144 aa  297  4e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3189  hypothetical protein  93.71 
 
 		 144 aa  280  5.000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.843747  hitchhiker  0.000188567 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0775  hypothetical protein  93.06 
 
 		 144 aa  277  4e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.166535  normal  0.0251261 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0749  hypothetical protein  93.06 
 
 		 144 aa  277  4e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0457515 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3567  hypothetical protein  86.81 
 
 		 144 aa  258  2e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0675  hypothetical protein  86.81 
 
 		 144 aa  258  2e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3758  hypothetical protein  86.81 
 
 		 144 aa  258  2e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.307291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3635  hypothetical protein  86.81 
 
 		 144 aa  258  2e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0155201  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0783  hypothetical protein  81.94 
 
 		 144 aa  243  4.9999999999999997e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0252082  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0832  hypothetical protein  65.73 
 
 		 144 aa  206  6e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0735  hypothetical protein  67.36 
 
 		 144 aa  201  2e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3520  hypothetical protein  64.08 
 
 		 145 aa  201  2e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3190  hypothetical protein  65.03 
 
 		 162 aa  200  6e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.197114  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2976  hypothetical protein  65.03 
 
 		 145 aa  189  9e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0273469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2622  hypothetical protein  55.24 
 
 		 144 aa  174  3e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2988  hypothetical protein  61.97 
 
 		 145 aa  171  3.9999999999999995e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0442194  normal  0.198385 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0596  hypothetical protein  28.12 
 
 		 145 aa  44.7  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  4.33635e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000120  hypothetical protein  26.56 
 
 		 145 aa  41.2  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.107595  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>