18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_3775 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_3775  hypothetical protein  100 
 
 		 244 aa  508  1e-143  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4391  hypothetical protein  95.08 
 
 		 244 aa  486  1e-136  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0761  hypothetical protein  40.41 
 
 		 242 aa  195  5.000000000000001e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.367918  normal  0.569616 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4343  hypothetical protein  34.29 
 
 		 278 aa  158  8e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.226575  normal  0.271135 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2709  hypothetical protein  35.56 
 
 		 251 aa  157  2e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0324034  normal  0.326043 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0122  hypothetical protein  32.81 
 
 		 272 aa  128  7.000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.198033  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3133  hypothetical protein  34.85 
 
 		 269 aa  126  3e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.187467  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0116  hypothetical protein  33.74 
 
 		 233 aa  124  2e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37290  hypothetical protein  29.23 
 
 		 284 aa  110  1.0000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1152  hypothetical protein  29.26 
 
 		 291 aa  107  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1265  hypothetical protein  28.51 
 
 		 243 aa  102  5e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0342627  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1355  hypothetical protein  30.57 
 
 		 264 aa  92  7e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00228455  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1793  hypothetical protein  27.69 
 
 		 269 aa  80.9  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.211378  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003195  hypothetical protein  25 
 
 		 243 aa  79.7  0.00000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4166  hypothetical protein  27.54 
 
 		 193 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2124  hypothetical protein  22.48 
 
 		 219 aa  55.5  0.0000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.690102  normal  0.0464407 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2069  hypothetical protein  25.15 
 
 		 201 aa  50.4  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2295  hypothetical protein  31.18 
 
 		 208 aa  42.7  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00628302  normal  0.435641 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>