12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_3713 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_3713  hypothetical protein  100 
 
 		 115 aa  238  2.9999999999999997e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2370  hypothetical protein  89.69 
 
 		 101 aa  188  2.9999999999999997e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0362877  normal  0.149615 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2265  hypothetical protein  88.54 
 
 		 156 aa  187  5e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0836  hypothetical protein  42.86 
 
 		 131 aa  49.7  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.408825  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0922  hypothetical protein  75 
 
 		 291 aa  45.4  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0741  putative acetyltransferase  86.36 
 
 		 197 aa  44.3  0.0006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.871349  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0919  putative acetyltransferase  56.76 
 
 		 172 aa  44.3  0.0006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.240492  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0934  hypothetical protein  79.17 
 
 		 217 aa  43.9  0.0007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.140656  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0912  hypothetical protein  62.5 
 
 		 61 aa  42  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.281616  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0743  hypothetical protein  85.71 
 
 		 45 aa  41.6  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.472162  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0798  putative acetyltransferase  63.33 
 
 		 230 aa  41.6  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0808  putative acetyltransferase  72 
 
 		 50 aa  40.4  0.009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>