18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_2854 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_2854  hypothetical protein  100 
 
 		 199 aa  417  1e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1519  hypothetical protein  89.23 
 
 		 199 aa  373  1e-103  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000380714  normal  0.0491707 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1586  hypothetical protein  87.69 
 
 		 199 aa  368  1e-101  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.196957  normal  0.0760005 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1580  hypothetical protein  87.18 
 
 		 199 aa  365  1e-100  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.530554  normal  0.0781928 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2635  hypothetical protein  79.38 
 
 		 198 aa  332  2e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.895876  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2749  hypothetical protein  78.87 
 
 		 198 aa  332  2e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.188485  normal  0.0271892 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1714  hypothetical protein  78.97 
 
 		 198 aa  328  2e-89  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0456721  hitchhiker  0.000000514861 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2670  hypothetical protein  77.95 
 
 		 198 aa  324  6e-88  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0249485  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2832  hypothetical protein  65.1 
 
 		 194 aa  279  2e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00830995 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1755  hypothetical protein  64.58 
 
 		 192 aa  276  1e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.196459  normal  0.218269 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2367  hypothetical protein  61.14 
 
 		 196 aa  262  3e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.406853  normal  0.0535079 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1699  hypothetical protein  57.29 
 
 		 193 aa  235  4e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1526  hypothetical protein  55.44 
 
 		 196 aa  213  9.999999999999999e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0874  hypothetical protein  35.51 
 
 		 159 aa  78.2  0.00000000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00470179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0006  hypothetical protein  29.27 
 
 		 204 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4581  hypothetical protein  30.83 
 
 		 196 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001840  hypothetical protein  30.67 
 
 		 115 aa  47.4  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4214  hypothetical protein  30.1 
 
 		 228 aa  41.6  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.285244  normal  0.47016 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>