19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_1854 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_1603  hypothetical protein  64.1 
 
 		 625 aa  775    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00349835  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1777  hypothetical protein  83.28 
 
 		 608 aa  1059    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00185901  hitchhiker  0.000156228 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2146  hypothetical protein  54.28 
 
 		 637 aa  681    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00198239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2682  hypothetical protein  83.28 
 
 		 608 aa  1059    Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000455476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1949  hypothetical protein  57.1 
 
 		 618 aa  686    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000191587  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2470  hypothetical protein  62.38 
 
 		 620 aa  790    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000205608  hitchhiker  0.00654791 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2607  hypothetical protein  83.11 
 
 		 608 aa  1056    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000464347  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1635  hypothetical protein  82.98 
 
 		 609 aa  1062    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0185934  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1815  hypothetical protein  57.76 
 
 		 617 aa  706    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000383708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2567  hypothetical protein  79.77 
 
 		 611 aa  1011    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00371664  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1604  hypothetical protein  90.66 
 
 		 607 aa  1103    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000915226  normal  0.134718 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2658  hypothetical protein  61.23 
 
 		 629 aa  761    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.142144  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1610  hypothetical protein  90.82 
 
 		 608 aa  1118    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.179059  normal  0.203284 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1543  hypothetical protein  90.66 
 
 		 608 aa  1115    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0643256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2467  hypothetical protein  59.2 
 
 		 624 aa  752    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000132009  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1854  hypothetical protein  100 
 
 		 610 aa  1249    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2007  hypothetical protein  29.36 
 
 		 565 aa  147  5e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0554485  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3276  hypothetical protein  30.02 
 
 		 613 aa  139  1e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1429  hypothetical protein  27.2 
 
 		 576 aa  125  2e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0373606  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>