16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_1489 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1489  hypothetical protein  100 
 
 		 135 aa  288  3e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2841  hypothetical protein  95.93 
 
 		 124 aa  253  5e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.126178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2763  hypothetical protein  94.31 
 
 		 124 aa  250  4.0000000000000004e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.160666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2939  hypothetical protein  94.31 
 
 		 124 aa  250  5.000000000000001e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1243  hypothetical protein  92.68 
 
 		 123 aa  247  5e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1320  hypothetical protein  91.74 
 
 		 121 aa  241  3e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1311  hypothetical protein  91.74 
 
 		 121 aa  241  3e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1347  hypothetical protein  91.74 
 
 		 121 aa  241  3e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3039  hypothetical protein  91.74 
 
 		 121 aa  241  3e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2799  hypothetical protein  78.51 
 
 		 121 aa  210  4.9999999999999996e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2579  hypothetical protein  79.83 
 
 		 128 aa  207  5e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2456  hypothetical protein  75 
 
 		 120 aa  197  6e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1162  hypothetical protein  66.67 
 
 		 124 aa  183  8e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00416619 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1254  hypothetical protein  64.17 
 
 		 120 aa  173  8e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.588078 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1355  hypothetical protein  63.33 
 
 		 120 aa  172  9.999999999999999e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000473524 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1149  hypothetical protein  64.17 
 
 		 120 aa  171  2.9999999999999996e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>