19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_0320 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0320  hypothetical protein  100 
 
 		 335 aa  677    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3865  acyltransferase 3  91.94 
 
 		 345 aa  636    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00949933 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3653  acyltransferase 3  91.04 
 
 		 345 aa  628  1e-179  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0291  acyltransferase 3  91.04 
 
 		 345 aa  628  1e-179  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3970  acyltransferase 3  87.76 
 
 		 345 aa  617  1e-175  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4165  acyltransferase 3  87.76 
 
 		 345 aa  616  1e-175  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4047  acyltransferase 3  87.46 
 
 		 345 aa  615  1e-175  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4078  acyltransferase 3  87.76 
 
 		 345 aa  617  1e-175  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3675  acyltransferase 3  83.58 
 
 		 345 aa  578  1e-164  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3331  hypothetical protein  57.52 
 
 		 349 aa  385  1e-106  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0102  acyltransferase 3  39.76 
 
 		 368 aa  249  5e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0248047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1771  acyltransferase 3  34.28 
 
 		 345 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1158  acyltransferase 3  34.96 
 
 		 385 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00977171  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3659  hypothetical protein  30.68 
 
 		 346 aa  111  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.421403 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2178  acyltransferase domain, membrane protein  26.59 
 
 		 348 aa  79  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2797  acyltransferase 3  24.09 
 
 		 363 aa  53.1  0.000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1380  hypothetical protein  25.96 
 
 		 321 aa  52  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.786153 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3838  acyltransferase 3  23.05 
 
 		 347 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0792  hypothetical protein  22.25 
 
 		 359 aa  44.3  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.298441  normal  0.0360506 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>