40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_0198.1 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0198.1  putative transposase  100 
 
 		 43 aa  83.6  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3923  transposase IS3/IS911 family protein  80.95 
 
 		 94 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1963  transposase IS3/IS911 family protein  80.95 
 
 		 94 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1466  transposase IS3/IS911 family protein  80.95 
 
 		 94 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0174  transposase IS3/IS911 family protein  80.95 
 
 		 94 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1227  transposase IS3/IS911 family protein  69.77 
 
 		 99 aa  57.8  0.00000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06246  hypothetical protein  69.05 
 
 		 70 aa  57.8  0.00000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2944  IS3, transposase orfA  62.79 
 
 		 99 aa  54.3  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  6.3441799999999996e-27 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0357  IS3 transposase OrfA  65 
 
 		 99 aa  54.3  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.562074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1238  IS3 OrfA  62.5 
 
 		 99 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.431772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1117  IS3 OrfA  62.5 
 
 		 99 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.201448  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1147  IS3, transposase orfA  65 
 
 		 99 aa  52  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01359  putative transposase-related protein  65 
 
 		 102 aa  52  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.145124  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1772  IS3, transposase orfA  65 
 
 		 99 aa  52  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.270264  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3024  IS3, transposase orfA  65 
 
 		 99 aa  52  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.433294  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4846  IS3, transposase orfA  65 
 
 		 99 aa  52  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0728  transposase IS3/IS911 family protein  65 
 
 		 99 aa  52  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.999071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2569  transposase IS3/IS911 family protein  65 
 
 		 99 aa  52  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.078573 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3717  transposase IS3/IS911 family protein  65 
 
 		 99 aa  52  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.615031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3745  transposase IS3/IS911 family protein  65 
 
 		 99 aa  52  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0203126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3156  ISEc16 transposase orfA  69.23 
 
 		 99 aa  51.6  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.489208  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01036  hypothetical protein  65 
 
 		 102 aa  52  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0083  IS3, transposase orfA  65 
 
 		 99 aa  52  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.013235  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01029  putative transposase-related protein  65 
 
 		 102 aa  52  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01524  putative transposase-related protein  65 
 
 		 102 aa  52  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02695  putative transposase-related protein  65 
 
 		 102 aa  52  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.772796  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1570  transposase IS3/IS911 family protein  65 
 
 		 99 aa  52  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.256983  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2507  transposase IS3/IS911 family protein  65 
 
 		 99 aa  52  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.419774  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2615  transposase IS3/IS911 family protein  65 
 
 		 99 aa  52  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0374663  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3236  transposase IS3/IS911 family protein  65 
 
 		 99 aa  52  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3305  transposase IS3/IS911 family protein  65 
 
 		 99 aa  52  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.130076  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0078  IS3, transposase orfA  65 
 
 		 99 aa  52  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.598745  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1146  IS3, transposase orfA  65 
 
 		 99 aa  52  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0273368  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0615  transposase IS3/IS911 family protein  65 
 
 		 97 aa  49.7  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.511326  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0766  transposase IS3/IS911 family protein  65 
 
 		 97 aa  49.7  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1291  transposase IS3/IS911 family protein  65 
 
 		 97 aa  49.7  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.214912  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4201  transposase IS3/IS911 family protein  65 
 
 		 98 aa  49.7  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1287  transposase IS3/IS911 family protein  65 
 
 		 97 aa  49.3  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.439238  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16540  Transposase IS3/IS911  57.5 
 
 		 92 aa  42  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20550  Transposase IS3/IS911  57.5 
 
 		 92 aa  42  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>