50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A4657 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011083  SeHA_C4658  hypothetical protein  99.67 
 
 		 301 aa  617  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4657  hypothetical protein  100 
 
 		 301 aa  619  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4566  hypothetical protein  99 
 
 		 301 aa  613  9.999999999999999e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.859711  normal  0.266567 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4706  SdiA-regulated family protein  99.65 
 
 		 286 aa  583  1.0000000000000001e-165  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4573  sdiA-regulated family protein  99.65 
 
 		 286 aa  583  1.0000000000000001e-165  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3272  SdiA-regulated protein  35.82 
 
 		 325 aa  166  4e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4878  SdiA-regulated protein  34.59 
 
 		 329 aa  163  3e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.60346 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4933  hypothetical protein  35.17 
 
 		 323 aa  162  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4561  hypothetical protein  34.86 
 
 		 323 aa  161  1e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3731  SdiA-regulated domain-containing protein  34.86 
 
 		 286 aa  161  2e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00663861  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04165  hypothetical protein  34.51 
 
 		 322 aa  160  3e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00151161  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04202  hypothetical protein  34.51 
 
 		 322 aa  160  3e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00228683  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5845  SdiA-regulated protein  34.03 
 
 		 280 aa  160  3e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.539509 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3663  SdiA-regulated domain protein  34.15 
 
 		 323 aa  160  4e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000154748  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4227  SdiA-regulated domain-containing protein  36.22 
 
 		 303 aa  159  7e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4772  conserved hypothetical protein yjiK  34.51 
 
 		 323 aa  157  3e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38420  hypothetical protein  34.7 
 
 		 309 aa  154  1e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.224716 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22840  SdiA-regulated domain-containing protein  36.03 
 
 		 308 aa  155  1e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0239521  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07110  hypothetical protein  34.63 
 
 		 317 aa  152  8e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.187526  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5204  SdiA-regulated domain-containing protein  32.23 
 
 		 300 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0314  SdiA-regulated domain-containing protein  33.07 
 
 		 303 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.183725 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5151  SdiA-regulated domain protein  33.2 
 
 		 300 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.965879  normal  0.786945 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5058  SdiA-regulated domain-containing protein  33.2 
 
 		 300 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0993064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5383  SdiA-regulated  33.85 
 
 		 305 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.02449 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5290  hypothetical protein  34.28 
 
 		 312 aa  146  5e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.842454  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4848  SdiA-regulated  32.86 
 
 		 317 aa  142  5e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04270  putative transcriptional regulator  33.84 
 
 		 321 aa  142  8e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.510674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0418  hypothetical protein  33.46 
 
 		 321 aa  142  8e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5589  hypothetical protein  35.69 
 
 		 326 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4229  SdiA-regulated domain-containing protein  34.86 
 
 		 317 aa  135  9e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5110  SdiA-regulated  36.05 
 
 		 326 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5082  sdiA-regulated domain protein  34.29 
 
 		 272 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.142061 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04160  putatitve transcriptional regulator  33.21 
 
 		 329 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0412  putatitve transcriptional regulator  34.69 
 
 		 310 aa  125  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.470848  n/a   
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0044  SrgB  34.45 
 
 		 282 aa  123  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.880775 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4588  SrgB  34.45 
 
 		 282 aa  123  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.537966  normal  0.854638 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0313  SdiA-regulated domain-containing protein  31.07 
 
 		 306 aa  122  7e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.124016 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5205  SdiA-regulated domain-containing protein  31.38 
 
 		 305 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.520929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4679  hypothetical protein  33.61 
 
 		 282 aa  122  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5059  SdiA-regulated domain-containing protein  31.79 
 
 		 306 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.181452  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48290  hypothetical protein  29.55 
 
 		 305 aa  119  4.9999999999999996e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4849  SdiA-regulated  30.87 
 
 		 314 aa  119  7e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5152  SdiA-regulated domain protein  31.07 
 
 		 306 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.767361 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5384  SdiA-regulated  30.5 
 
 		 307 aa  116  6e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0252012 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5291  hypothetical protein  30.25 
 
 		 310 aa  115  8.999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2428  hypothetical protein  25.83 
 
 		 302 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0451472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1215  inner membrane protein  24.6 
 
 		 280 aa  64.3  0.000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1269  inner membrane protein  26.72 
 
 		 268 aa  46.6  0.0005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1216  hypothetical protein  27.27 
 
 		 302 aa  44.3  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.256676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1385  putative extracellular nuclease  22.22 
 
 		 751 aa  42.7  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.14292  normal  0.827149 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>