27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0794 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP0794  fatty acid biosynthesis transcriptional regulator  100 
 
 
191 aa  388  1e-107  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1287  fatty acid biosynthesis transcriptional regulator  72.04 
 
 
190 aa  274  6e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.996878  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1312  fatty acid biosynthesis transcriptional regulator  72.04 
 
 
190 aa  274  6e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1969  fatty acid biosynthesis transcriptional regulator  49.17 
 
 
198 aa  170  1e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1078  fatty acid biosynthesis transcriptional regulator  48.09 
 
 
198 aa  169  2e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0274089  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2506  fatty acid biosynthesis transcriptional regulator  48.35 
 
 
197 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0307948  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3896  fatty acid biosynthesis transcriptional regulator  47.8 
 
 
197 aa  159  2e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000171057  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3868  fatty acid biosynthesis transcriptional regulator  47.8 
 
 
197 aa  159  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.58951e-43 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1290  fatty acid biosynthesis transcriptional regulator  46.56 
 
 
220 aa  159  2e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0131778  hitchhiker  0.000000000335465 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3953  fatty acid biosynthesis transcriptional regulator  48.35 
 
 
197 aa  160  2e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.025717  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3902  fatty acid biosynthesis transcriptional regulator  47.8 
 
 
197 aa  159  2e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000171979  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3992  fatty acid biosynthesis transcriptional regulator  47.8 
 
 
197 aa  159  2e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000544903  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3613  fatty acid biosynthesis transcriptional regulator  46.56 
 
 
250 aa  159  2e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000177478  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3595  fatty acid biosynthesis transcriptional regulator  46.56 
 
 
250 aa  159  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3705  fatty acid biosynthesis transcriptional regulator  46.56 
 
 
250 aa  159  2e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000903999  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3677  fatty acid biosynthesis transcriptional regulator  47.25 
 
 
197 aa  157  6e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0922721  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10240  fatty acid biosynthesis transcriptional regulator  43.58 
 
 
188 aa  154  7e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000167707  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1175  fatty acid biosynthesis transcriptional regulator  42.62 
 
 
197 aa  145  5e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000018345  normal  0.032129 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3822  fatty acid biosynthesis transcriptional regulator  40.91 
 
 
189 aa  141  6e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00703376  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1728  fatty acid biosynthesis transcriptional regulator  41.08 
 
 
200 aa  141  7e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000185888  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0943  fatty acid biosynthesis transcriptional regulator  39.31 
 
 
194 aa  140  9e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000300169  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1341  fatty acid biosynthesis transcriptional regulator  39.23 
 
 
203 aa  129  2.0000000000000002e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.484304  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2077  fatty acid biosynthesis transcriptional regulator  41.44 
 
 
190 aa  129  3e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00126885  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0938  fatty acid biosynthesis transcriptional regulator  37.57 
 
 
188 aa  125  5e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0267853  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0680  fatty acid biosynthesis transcriptional regulator  37.91 
 
 
194 aa  122  4e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000200917  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1102  transcriptional regulator, DeoR family  34.1 
 
 
194 aa  120  9.999999999999999e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000334367  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1152  fatty acid biosynthesis transcriptional regulator  31.52 
 
 
191 aa  98.6  5e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000106679  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>