15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0258 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0258  CRISPR-associated APE2256 family protein  100 
 
 		 373 aa  761    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5837  CRISPR-associated protein, APE2256 family  34.44 
 
 		 383 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3107  hypothetical protein  31.44 
 
 		 371 aa  165  9e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1263  CRISPR-associated protein APE2256 family  28.24 
 
 		 253 aa  68.6  0.0000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15100  putative CRISPR-associated protein, APE2256 family  25.11 
 
 		 404 aa  67  0.0000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3373  hypothetical protein  27.02 
 
 		 348 aa  65.5  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0958  CRISPR-associated APE2256 family protein  26.4 
 
 		 346 aa  63.9  0.000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.689392 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1509  CRISPR-associated protein APE2256 family  24.43 
 
 		 298 aa  60.8  0.00000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.113599  normal  0.470127 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1342  CRISPR-associated protein APE2256 family  26.11 
 
 		 278 aa  60.5  0.00000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.330295  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1479  APE2256 family CRISPR-associated protein  24.53 
 
 		 354 aa  50.1  0.00007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.394423 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0313  hypothetical protein  24.82 
 
 		 399 aa  49.7  0.00008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000475794  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2271  CRISPR-associated protein, APE2256 family  21.26 
 
 		 321 aa  49.7  0.00009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.452676  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0745  CRISPR-associated protein APE2256 family  30.82 
 
 		 368 aa  49.3  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1656  CRISPR-associated protein APE2256 family  27.5 
 
 		 375 aa  45.8  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0169075  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1191  CRISPR-associated protein, APE2256 family  25.22 
 
 		 398 aa  43.9  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>