15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3236 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009429  Rsph17025_3236  hypothetical protein  100 
 
 		 92 aa  195  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1088  hypothetical protein  38.64 
 
 		 98 aa  62.8  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.37333 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0544  hypothetical protein  35.8 
 
 		 90 aa  57  0.00000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1312  hypothetical protein  38.3 
 
 		 101 aa  54.7  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0221873  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0429  hypothetical protein  33.33 
 
 		 98 aa  51.2  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000000727417  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3190  hypothetical protein  32.56 
 
 		 92 aa  50.4  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.727862  normal  0.383521 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2449  hypothetical protein  31.76 
 
 		 92 aa  47.4  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3516  hypothetical protein  33.33 
 
 		 101 aa  46.2  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1197  hypothetical protein  30.43 
 
 		 99 aa  45.4  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0178983  decreased coverage  0.0000807551 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47020  hypothetical protein  32.14 
 
 		 97 aa  45.1  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2217  hypothetical protein  30.59 
 
 		 92 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.819518  normal  0.40781 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2541  hypothetical protein  35.16 
 
 		 109 aa  43.5  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0801  hypothetical protein  27.06 
 
 		 90 aa  43.5  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0391557 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3246  hypothetical protein  28.92 
 
 		 92 aa  40.8  0.007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2047  hypothetical protein  27.06 
 
 		 91 aa  40.8  0.007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>