55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2902 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2902  hypothetical protein  100 
 
 		 193 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.767422  normal  0.40239 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0147  hypothetical protein  94.3 
 
 		 193 aa  363  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.126883 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1496  hypothetical protein  94.3 
 
 		 193 aa  363  1e-100  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2668  hypothetical protein  68.23 
 
 		 192 aa  285  2e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0580276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0062  hypothetical protein  68.39 
 
 		 195 aa  251  4.0000000000000004e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0191236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0068  lipoprotein  60.62 
 
 		 194 aa  239  1e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000291944 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0430  putative lipoprotein  62.3 
 
 		 192 aa  236  2e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3324  hypothetical protein  46.52 
 
 		 205 aa  189  2e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109882 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1331  hypothetical protein  45.79 
 
 		 205 aa  188  4e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.131922 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3447  putative lipoprotein  49.46 
 
 		 197 aa  188  5e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.002618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1229  hypothetical protein  46.84 
 
 		 205 aa  184  5e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1038  hypothetical protein  45.41 
 
 		 205 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1210  hypothetical protein  44.21 
 
 		 205 aa  177  9e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3557  hypothetical protein  43.92 
 
 		 205 aa  176  1e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1074  hypothetical protein  45.45 
 
 		 205 aa  177  1e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2978  hypothetical protein  42.63 
 
 		 205 aa  174  6e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.294635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1134  hypothetical protein  45.21 
 
 		 217 aa  173  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1100  hypothetical protein  45.21 
 
 		 217 aa  173  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3060  hypothetical protein  42.11 
 
 		 205 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.272775  normal  0.469767 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1221  hypothetical protein  46.47 
 
 		 228 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3158  hypothetical protein  42.11 
 
 		 205 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.191231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1033  hypothetical protein  43.85 
 
 		 217 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.935593  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3258  hypothetical protein  43.01 
 
 		 217 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.077733 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1060  hypothetical protein  45.14 
 
 		 203 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1365  hypothetical protein  46.99 
 
 		 198 aa  171  5e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1361  hypothetical protein  46.45 
 
 		 198 aa  170  1e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2173  hypothetical protein  49.11 
 
 		 234 aa  166  2e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0780723  normal  0.253338 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02762  putative lipoprotein  43.39 
 
 		 212 aa  164  8e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0691373  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3012  transcriptional regulatory protein  47.06 
 
 		 198 aa  162  3e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03485  hypothetical protein  45.56 
 
 		 187 aa  162  4.0000000000000004e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2633  hypothetical protein  43.75 
 
 		 206 aa  160  9e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4077  putative lipoprotein  46.84 
 
 		 206 aa  160  9e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.364574  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2230  hypothetical protein  45.83 
 
 		 210 aa  160  1e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0644  putative lipoprotein  43.32 
 
 		 199 aa  158  5e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2832  transcriptional regulatory protein  41.58 
 
 		 231 aa  157  9e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000741342  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002531  hypothetical protein  43.96 
 
 		 188 aa  156  2e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1367  putative lipoprotein  41.24 
 
 		 218 aa  155  3e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0710  putative lipoprotein  44.38 
 
 		 189 aa  154  1e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.147777  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0984  hypothetical protein  44.97 
 
 		 218 aa  153  1e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00101229  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1882  transcriptional regulatory protein  44.97 
 
 		 204 aa  151  5e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.622701  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0021  hypothetical protein  44.71 
 
 		 212 aa  150  8e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1944  hypothetical protein  40.44 
 
 		 215 aa  150  1e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0808013  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2157  hypothetical protein  44.12 
 
 		 212 aa  147  1.0000000000000001e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.563893  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3372  putative lipoprotein  43.48 
 
 		 204 aa  144  6e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2885  hypothetical protein  44.71 
 
 		 209 aa  144  8.000000000000001e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0501836  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1048  hypothetical protein  44.63 
 
 		 248 aa  143  2e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1881  hypothetical protein  43.35 
 
 		 190 aa  141  6e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0204  hypothetical protein  38.66 
 
 		 193 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0234  hypothetical protein  38.66 
 
 		 193 aa  139  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1317  putative lipoprotein  41.62 
 
 		 196 aa  136  2e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1205  putative lipoprotein  41.54 
 
 		 194 aa  136  2e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1168  putative lipoprotein  41.36 
 
 		 194 aa  136  2e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0748418  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3587  hypothetical protein  43.02 
 
 		 194 aa  133  9.999999999999999e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.503233  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1984  lytic transglycosylase catalytic  40.64 
 
 		 194 aa  131  6e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2221  putative transmembrane protein  43.09 
 
 		 189 aa  131  6e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.860046  normal  0.348957 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>