14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_1084 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_1084  hypothetical protein  100 
 
 		 66 aa  127  5.0000000000000004e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0473834 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1139  hypothetical protein  81.82 
 
 		 66 aa  84.7  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.529496 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2474  hypothetical protein  80.3 
 
 		 172 aa  83.6  8e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0542451  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1067  hypothetical protein  51.61 
 
 		 71 aa  63.5  0.0000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.126814 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1641  hypothetical protein  49.21 
 
 		 74 aa  62  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.791743 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2111  hypothetical protein  49.21 
 
 		 67 aa  57  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00358078  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2892  hypothetical protein  52.38 
 
 		 70 aa  53.9  0.0000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.35936  normal  0.223625 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1176  hypothetical protein  44.93 
 
 		 70 aa  52.8  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.829742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1985  hypothetical protein  44.44 
 
 		 65 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.767846  normal  0.505926 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3463  hypothetical protein  41.54 
 
 		 67 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0791609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1421  hypothetical protein  45.9 
 
 		 70 aa  48.9  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1819  hypothetical protein  44.83 
 
 		 75 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.286234  normal  0.33037 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3163  hypothetical protein  43.1 
 
 		 69 aa  43.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0298135  normal  0.0124686 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1347  gene transfer agent (GTA) orfg10  44.44 
 
 		 62 aa  42.4  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.000217924  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>