14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3122 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3122  hypothetical protein  100 
 
 		 94 aa  183  7e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0275  hypothetical protein  53.95 
 
 		 83 aa  87.4  5e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0227705  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1963  hypothetical protein  41.38 
 
 		 96 aa  82  0.000000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0133  hypothetical protein  45.88 
 
 		 95 aa  76.6  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2433  hypothetical protein  49.33 
 
 		 90 aa  72.4  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.776555  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0698  hypothetical protein  44.74 
 
 		 83 aa  69.3  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1572  hypothetical protein  44.74 
 
 		 84 aa  68.2  0.00000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.667787  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1932  hypothetical protein  45.88 
 
 		 92 aa  65.1  0.0000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1559  hypothetical protein  48.53 
 
 		 89 aa  64.7  0.0000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2340  hypothetical protein  43.84 
 
 		 85 aa  59.7  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.190465  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1394  hypothetical protein  43.66 
 
 		 88 aa  59.7  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0852964  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2521  hypothetical protein  50 
 
 		 83 aa  60.1  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0165247 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4028  hypothetical protein  45.12 
 
 		 91 aa  59.3  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3057  phosphopantetheine-binding  43.48 
 
 		 82 aa  41.2  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.245048  hitchhiker  0.00204807 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>