24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2386 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2386  hypothetical protein  100 
 
 		 133 aa  268  2e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.417622  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6643  hypothetical protein  44.74 
 
 		 123 aa  90.1  9e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.174293  normal  0.0338703 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5301  hypothetical protein  37.5 
 
 		 126 aa  77.4  0.00000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1360  hypothetical protein  36.52 
 
 		 125 aa  73.9  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003192  cytochrome P-450:NADPH-P-450 reductase  32.17 
 
 		 124 aa  73.2  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1604  hypothetical protein  41.67 
 
 		 123 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6227  hypothetical protein  41.67 
 
 		 123 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0274044 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6703  hypothetical protein  40.91 
 
 		 123 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.640276 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2891  hypothetical protein  31.43 
 
 		 162 aa  69.3  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00674901 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1428  hypothetical protein  34.21 
 
 		 122 aa  68.2  0.00000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0545971  normal  0.100663 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0528  hypothetical protein  35.14 
 
 		 121 aa  67.8  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5385  hypothetical protein  31.2 
 
 		 125 aa  66.6  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5729  hypothetical protein  44.35 
 
 		 123 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5974  hypothetical protein  42.61 
 
 		 123 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0237314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3211  hypothetical protein  32.11 
 
 		 127 aa  53.5  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.750563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1762  hypothetical protein  25.89 
 
 		 122 aa  52  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000014104  normal  0.309423 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1879  putative secreted protein  31.9 
 
 		 137 aa  45.8  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.562565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0674  hypothetical protein  27.78 
 
 		 138 aa  45.1  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4144  hypothetical protein  29.91 
 
 		 127 aa  43.9  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.752301 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5108  hypothetical protein  32 
 
 		 129 aa  42.7  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0458  hypothetical protein  26.98 
 
 		 135 aa  41.6  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0198  hypothetical protein  30.28 
 
 		 125 aa  40.8  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.241475 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3581  hypothetical protein  32.08 
 
 		 160 aa  40  0.01  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0717  hypothetical protein  31.2 
 
 		 122 aa  40  0.01  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>