27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0899 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0899  hypothetical protein  100 
 
 		 364 aa  723    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.96977  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4661  hypothetical protein  51.93 
 
 		 363 aa  319  6e-86  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.423075 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0805  hypothetical protein  45.38 
 
 		 364 aa  290  2e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1005  hypothetical protein  45.28 
 
 		 374 aa  289  6e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0276  hypothetical protein  47.9 
 
 		 364 aa  286  4e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0937  hypothetical protein  43.85 
 
 		 364 aa  278  9e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1346  hypothetical protein  45.25 
 
 		 359 aa  278  1e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3881  hypothetical protein  42.5 
 
 		 359 aa  273  4.0000000000000004e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0658  hypothetical protein  42.5 
 
 		 359 aa  273  4.0000000000000004e-72  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.515936  normal  0.0682972 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3793  hypothetical protein  42.5 
 
 		 359 aa  273  4.0000000000000004e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.625203  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3690  hypothetical protein  43.14 
 
 		 360 aa  265  8e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.326326  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1270  hypothetical protein  41.23 
 
 		 369 aa  264  2e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33900  hypothetical protein  43.99 
 
 		 390 aa  249  6e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.316794  normal  0.688952 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0581  hypothetical protein  38.57 
 
 		 396 aa  249  8e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0084  hypothetical protein  41.13 
 
 		 399 aa  245  9.999999999999999e-64  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3011  hypothetical protein  43.41 
 
 		 393 aa  239  5.999999999999999e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000441117  hitchhiker  0.000201325 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0342  hypothetical protein  39.62 
 
 		 405 aa  236  6e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5099  hypothetical protein  37.19 
 
 		 370 aa  230  3e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0753  hypothetical protein  39.43 
 
 		 393 aa  229  4e-59  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.176602 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4763  hypothetical protein  41.55 
 
 		 375 aa  229  6e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0141  hypothetical protein  37.19 
 
 		 370 aa  228  9e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5093  hypothetical protein  37.09 
 
 		 370 aa  227  3e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3305  hypothetical protein  42.43 
 
 		 385 aa  225  9e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0294126  normal  0.309203 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0756  hypothetical protein  38.08 
 
 		 397 aa  224  2e-57  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.608689  normal  0.219757 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1064  hypothetical protein  41.76 
 
 		 389 aa  222  7e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.819996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3668  hypothetical protein  41.73 
 
 		 385 aa  219  7e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3187  hypothetical protein  41.96 
 
 		 384 aa  218  1e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00200336  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>